More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0214 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  99.08 
 
 
325 aa  647    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  100 
 
 
325 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3291  ApbE family lipoprotein  64.33 
 
 
330 aa  358  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.238915  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2739  ApbE family lipoprotein  51.79 
 
 
321 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5388  ApbE-like lipoprotein  53.31 
 
 
329 aa  291  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3437  ApbE family lipoprotein  50.77 
 
 
327 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0181711  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5164  ApbE-like lipoprotein  51.23 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4089  ApbE family lipoprotein  50.77 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.224372 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0899  ApbE family protein  46.29 
 
 
365 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.624097  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4966  ApbE family lipoprotein  51.29 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475076  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3394  ApbE family lipoprotein  49.34 
 
 
315 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1597  ApbE family lipoprotein  50.17 
 
 
305 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.727207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3099  ApbE family lipoprotein  48.28 
 
 
320 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  41.5 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  44.97 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0494  ApbE family protein  40.31 
 
 
394 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1982  ApbE family protein  40.31 
 
 
394 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.63389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2079  ApbE family protein  40.84 
 
 
394 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  40.46 
 
 
326 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  39.8 
 
 
342 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1630  ApbE family protein  58.15 
 
 
404 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0677  ApbE family protein  58.15 
 
 
404 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0780  ApbE family protein  58.15 
 
 
404 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.725216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0565  ApbE family protein  58.15 
 
 
404 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  41.03 
 
 
349 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  42.12 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  39.25 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  40 
 
 
349 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  40.27 
 
 
335 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  40 
 
 
326 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  40.58 
 
 
800 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2816  ApbE-like lipoprotein  38.76 
 
 
338 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  37.88 
 
 
332 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  35.43 
 
 
337 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3636  ApbE-like lipoprotein  39.12 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  35.22 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.69 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  39.19 
 
 
337 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  34.85 
 
 
341 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  37.5 
 
 
341 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  38.31 
 
 
331 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  39.07 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  34.22 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 
374 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  35.05 
 
 
379 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.52 
 
 
367 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 
348 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 
348 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 
348 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  35.35 
 
 
348 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 
374 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 
347 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  38.25 
 
 
341 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  34.48 
 
 
337 aa  169  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.81 
 
 
334 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.8 
 
 
347 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  35.35 
 
 
343 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  34.14 
 
 
338 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0984  ApbE family lipoprotein  40.13 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.174547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2878  ApbE family lipoprotein  41.41 
 
 
348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  38.03 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  38.03 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  38.03 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  34.25 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3418  ApbE-like lipoprotein  35.62 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.999205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  34.14 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  32.66 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1900  ApbE-like lipoprotein  33.33 
 
 
327 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  0.0133899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  32.54 
 
 
338 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 
332 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  36.05 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.44 
 
 
351 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  33.79 
 
 
345 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 
338 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  32.3 
 
 
332 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  31.29 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33.79 
 
 
350 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  31.1 
 
 
351 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  31.1 
 
 
351 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  31.1 
 
 
351 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.1 
 
 
351 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.1 
 
 
351 aa  151  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  33.11 
 
 
341 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.1 
 
 
351 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.1 
 
 
351 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  39.93 
 
 
287 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.96 
 
 
361 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1686  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.79 
 
 
349 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.77 
 
 
351 aa  149  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  31.56 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.43 
 
 
351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2609  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.62 
 
 
350 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2402  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.62 
 
 
350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.62 
 
 
350 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  32.55 
 
 
341 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.62 
 
 
350 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4283  apbE family protein  29.51 
 
 
352 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2105  thiamine biosynthesis lipoprotein, putative  30.95 
 
 
343 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2506  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  30.29 
 
 
350 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>