More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0109 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  72.61 
 
 		 244 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  41.18 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  37.82 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 208 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 210 aa  105  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  34.02 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 222 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.03 
 
 		 207 aa  92  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 209 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 205 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  33 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  28.17 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  31.16 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.85 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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