48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0057 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  100 
 
 
239 aa  493  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  99.58 
 
 
239 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  57.96 
 
 
251 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  37.27 
 
 
225 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  34.25 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  36.28 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  33.18 
 
 
248 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  33.18 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  39.17 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  34.42 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  35.91 
 
 
234 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  35.51 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  36.92 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  38.92 
 
 
202 aa  132  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  34.72 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  35.16 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  34.39 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  34.39 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  34.42 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  32.71 
 
 
223 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  35.62 
 
 
240 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  31.38 
 
 
238 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  33.5 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  34.76 
 
 
215 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  32.67 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  31.84 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  29.61 
 
 
251 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  31.43 
 
 
227 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  30.33 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  31.56 
 
 
351 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0013  conjugal transfer protein TraG  32.94 
 
 
245 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.734906 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0027  conjugal transfer protein  33.52 
 
 
263 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  27.8 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  27.98 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  27.23 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  28.23 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  29.17 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  27.57 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7530  VirB8 family protein  28.25 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.587381  normal  0.0751978 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  29.94 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  29.81 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  32.18 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0022  VirB8  28.57 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  28.57 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0044  type IV secretion system protein VirB8  27.55 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.677049  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  26.48 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0001  VirB8  26.18 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  29.31 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>