More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_2079 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2167  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 
324 aa  655  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2079  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 
324 aa  655  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0054544  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0745  tRNA pseudouridine synthase B  92.9 
 
 
324 aa  620  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.555354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3932  tRNA pseudouridine synthase B  67.08 
 
 
312 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.138388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4065  tRNA pseudouridine synthase B  65.11 
 
 
310 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0171  tRNA pseudouridine synthase B  66.67 
 
 
309 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4385  tRNA pseudouridine synthase B  65.73 
 
 
310 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3443  tRNA pseudouridine synthase B  66.77 
 
 
310 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1256  tRNA pseudouridine synthase B  64.29 
 
 
320 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0033  tRNA pseudouridine synthase B  55.66 
 
 
412 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0059  tRNA pseudouridine synthase B  56.29 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  55.49 
 
 
335 aa  329  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  56.11 
 
 
354 aa  328  6e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0229  tRNA pseudouridine synthase B  53.77 
 
 
368 aa  327  2e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00860319  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0438  tRNA pseudouridine synthase B  53.96 
 
 
366 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  55.49 
 
 
342 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0482  tRNA pseudouridine synthase B  54.4 
 
 
387 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.266724  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0603  tRNA pseudouridine synthase B  53.77 
 
 
351 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0026  tRNA pseudouridine synthase B  52.83 
 
 
358 aa  320  2e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  52.66 
 
 
341 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  52.66 
 
 
341 aa  315  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  52.66 
 
 
341 aa  314  1e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  51.4 
 
 
363 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3630  tRNA pseudouridine synthase B  50.31 
 
 
307 aa  291  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.326344  normal  0.032374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3042  tRNA pseudouridine synthase B  47.53 
 
 
304 aa  283  3e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.877322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  48.87 
 
 
299 aa  283  3e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1045  tRNA pseudouridine synthase B  48.24 
 
 
300 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128429  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4034  tRNA pseudouridine synthase B  47.99 
 
 
301 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  46.13 
 
 
318 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  45.25 
 
 
301 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  45.25 
 
 
301 aa  275  1e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2770  tRNA pseudouridine synthase B  45.57 
 
 
301 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  44.48 
 
 
302 aa  268  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0039  tRNA pseudouridine synthase B  43.81 
 
 
310 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.651075  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2073  tRNA pseudouridine synthase B  45.51 
 
 
306 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.427039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2801  tRNA pseudouridine synthase B  45.45 
 
 
298 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.404125  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0441  tRNA pseudouridine synthase B  45.82 
 
 
311 aa  252  8e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  41.16 
 
 
308 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0336  tRNA pseudouridine synthase B  38.01 
 
 
301 aa  229  6e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.636591  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0728  tRNA pseudouridine synthase B  46.01 
 
 
296 aa  224  1e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  39.75 
 
 
305 aa  213  4e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  39.12 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  38.8 
 
 
305 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  40.68 
 
 
307 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  38.8 
 
 
305 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0541  tRNA pseudouridine synthase B  48.33 
 
 
318 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.578827  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  38.12 
 
 
306 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  38.17 
 
 
305 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0600  tRNA pseudouridine synthase B  37.96 
 
 
318 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  38.17 
 
 
305 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  38.8 
 
 
304 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3808  tRNA pseudouridine synthase B  41.58 
 
 
324 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0201981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  38.49 
 
 
304 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  37.93 
 
 
305 aa  201  2e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  38.07 
 
 
312 aa  197  2e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002611  tRNA pseudouridine synthase B  39.32 
 
 
317 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  38.82 
 
 
304 aa  196  4e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.95381e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2484  tRNA pseudouridine synthase B  41.52 
 
 
304 aa  196  4e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  38.65 
 
 
301 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  37.69 
 
 
324 aa  195  8e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  37.69 
 
 
324 aa  195  8e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  37.69 
 
 
324 aa  195  8e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3724  tRNA pseudouridine synthase B  46.61 
 
 
319 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03394  tRNA pseudouridine synthase B  39.51 
 
 
314 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  35.8 
 
 
314 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2205  tRNA pseudouridine synthase B  38.3 
 
 
318 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.344514  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0587  tRNA pseudouridine synthase B  37.23 
 
 
314 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  38.32 
 
 
308 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4487  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
314 aa  190  3e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0539  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3358  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3462  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0532  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03033  tRNA pseudouridine synthase B  36.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.975802  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02984  hypothetical protein  36.02 
 
 
314 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1747  tRNA pseudouridine synthase B  39.44 
 
 
304 aa  189  6e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108245  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  35.91 
 
 
308 aa  189  6e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3344  tRNA pseudouridine synthase B  37.99 
 
 
318 aa  189  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  39.56 
 
 
299 aa  188  9e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  36.07 
 
 
304 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.48729e-10  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3605  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 
314 aa  188  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01762  tRNA pseudouridine synthase B  37.12 
 
 
323 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258018  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3463  tRNA pseudouridine synthase B  35.2 
 
 
318 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3559  tRNA pseudouridine synthase B  37.42 
 
 
317 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  9.61174e-07 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3650  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 
314 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1697  tRNA pseudouridine synthase B  39.01 
 
 
317 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  37.3 
 
 
302 aa  185  1e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3058  tRNA pseudouridine synthase B  35.28 
 
 
315 aa  184  1e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.538597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0810  tRNA pseudouridine synthase B  41.28 
 
 
314 aa  184  2e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.384443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 
293 aa  184  2e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1465  tRNA pseudouridine synthase B  35.01 
 
 
318 aa  184  2e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3473  tRNA pseudouridine synthase B  36.05 
 
 
314 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0963  tRNA pseudouridine synthase B  37.35 
 
 
315 aa  183  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0397132  normal  0.0378785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0819  tRNA pseudouridine synthase B  38.75 
 
 
310 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0159  tRNA pseudouridine synthase B  32.57 
 
 
344 aa  183  4e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  36.36 
 
 
317 aa  183  4e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  43.75 
 
 
307 aa  182  5e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0823  tRNA pseudouridine synthase B  43.32 
 
 
308 aa  182  5e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.939729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 
310 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  38.68 
 
 
310 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>