More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1228 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1228  cold-shock family protein  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1266  cold-shock family protein  99.48 
 
 
193 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.397552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  95.34 
 
 
193 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384724  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.47 
 
 
192 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0373427  hitchhiker  0.000349803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1733  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 
197 aa  278  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1550  cold-shock DNA-binding domain protein  67.36 
 
 
192 aa  273  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2286  cold shock protein  71.74 
 
 
192 aa  273  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00549771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1744  cold-shock DNA-binding domain protein  66.84 
 
 
192 aa  271  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000196433  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4038  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.29 
 
 
217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1609  cold-shock protein, DNA-binding  67.61 
 
 
217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0789892  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2791  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.57 
 
 
220 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190915  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0834  cold-shock DNA-binding family protein  65.73 
 
 
179 aa  250  1e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.253832  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2938  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.14 
 
 
221 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2142  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.05 
 
 
217 aa  248  5e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2801  cold-shock DNA-binding domain protein  68.57 
 
 
235 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2530  cold-shock DNA-binding domain protein  69.14 
 
 
219 aa  247  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2736  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.44 
 
 
201 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0381  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.12 
 
 
204 aa  234  8e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.58799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3196  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 
181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1882  cold-shock DNA-binding domain protein  64.53 
 
 
189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3007  cold-shock protein DNA-binding  58.6 
 
 
202 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0372335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3232  cold-shock DNA-binding domain protein  61.93 
 
 
181 aa  228  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4174  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.43 
 
 
192 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0551  cold-shock DNA-binding domain protein  64.33 
 
 
189 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1552  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.35 
 
 
205 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.786136  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2974  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.29 
 
 
199 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.42307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.77 
 
 
201 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850387  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2557  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.98 
 
 
198 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557959  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1498  cold-shock DNA-binding protein family protein  38.92 
 
 
174 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.919918  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2474  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.62 
 
 
181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.251539  normal  0.0229175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1788  putative cold shock protein  37.95 
 
 
173 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000033725  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1149  cold-shock DNA-binding protein family protein  35.8 
 
 
179 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000107907  normal  0.195461 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1053  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.24 
 
 
180 aa  104  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2346  cold-shock DNA-binding protein family protein  38.61 
 
 
180 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1021  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.61 
 
 
180 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0436807  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0859  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  35.12 
 
 
197 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384047  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0105  cold-shock DNA-binding domain protein  32.96 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.310654  normal  0.194385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0538  cold-shock DNA-binding domain protein  34.16 
 
 
217 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1528  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  32.56 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0192  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.28 
 
 
241 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171575  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2262  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.44 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0346  cold-shock DNA-binding domain protein  29.21 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.631485  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3723  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  31.01 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  32.08 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0144  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  28.06 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3142  cold-shock DNA-binding protein family protein  34.06 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3156  cold-shock DNA-binding domain protein  27.78 
 
 
268 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04410  cold shock domain protein CspD  31.61 
 
 
317 aa  71.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  27.51 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2344  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  29.24 
 
 
249 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0312  cold-shock DNA-binding domain protein  31.74 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.147611  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
67 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3078  cold-shock DNA-binding domain protein  46.97 
 
 
67 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
67 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  39.68 
 
 
67 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
67 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
67 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  37.31 
 
 
67 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  37.31 
 
 
67 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  37.31 
 
 
67 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.14 
 
 
69 aa  62  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.54 
 
 
67 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5340  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.42 
 
 
83 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  37.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  37.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  37.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  37.31 
 
 
67 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  32.86 
 
 
69 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  37.31 
 
 
67 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  40.91 
 
 
67 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2901  cold-shock DNA-binding protein family protein  29.76 
 
 
288 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5816  major cold shock protein  40.91 
 
 
67 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  40.3 
 
 
68 aa  61.2  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2698  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.81 
 
 
70 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.089353  normal  0.418887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0913  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.45 
 
 
67 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587921  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  35.82 
 
 
67 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6397  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
67 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.257839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5888  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
67 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232235  normal  0.225892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3185  cold-shock protein, DNA-binding  36.36 
 
 
92 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.68 
 
 
67 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03487  putative cold shock-like protein cspG  38.57 
 
 
69 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
67 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3262  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.26 
 
 
87 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.39 
 
 
70 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  60.5  0.00000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5524  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
67 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.62 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 
67 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  32.86 
 
 
69 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>