More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1169 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0319  recombination factor protein RarA  75.4 
 
 
440 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  0.0653237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  72.3 
 
 
447 aa  648    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5037  recombination factor protein RarA  75.64 
 
 
444 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1206  recombination factor protein RarA  99.77 
 
 
437 aa  892    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2484  recombination factor protein RarA  85.94 
 
 
435 aa  770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1392  recombination factor protein RarA  76.96 
 
 
443 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1015  recombination factor protein RarA  84.37 
 
 
436 aa  760    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00103733  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2994  AAA ATPase central domain protein  74.31 
 
 
437 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4770  recombination factor protein RarA  78.57 
 
 
436 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1169  recombination factor protein RarA  100 
 
 
437 aa  895    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0725259  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2324  recombination factor protein RarA  75.29 
 
 
444 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3416  recombination factor protein RarA  74.6 
 
 
442 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.384623  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1464  recombination factor protein RarA  82.11 
 
 
438 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.519548  normal  0.727455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3155  recombination factor protein RarA  75.81 
 
 
443 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1573  recombination factor protein RarA  76.35 
 
 
446 aa  681    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.319389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1650  recombination factor protein RarA  82.84 
 
 
440 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  74.59 
 
 
443 aa  678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0275  recombination factor protein RarA  75.4 
 
 
437 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  93.59 
 
 
438 aa  843    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2042  ATPase central domain-containing protein  76.55 
 
 
435 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1365  recombination factor protein RarA  81.65 
 
 
438 aa  730    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159331  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0350  recombination factor protein RarA  76.55 
 
 
440 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0726  recombination factor protein RarA  74.83 
 
 
439 aa  691    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.658884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  72.48 
 
 
437 aa  618  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7127  recombination factor protein RarA  72.6 
 
 
437 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2765  recombination factor protein RarA  68.74 
 
 
434 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.70632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2660  recombination factor protein RarA  66.43 
 
 
439 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0313  recombination factor protein RarA  65.53 
 
 
436 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0882  recombination factor protein RarA  63.7 
 
 
481 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455086  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0389  recombination factor protein RarA  63.47 
 
 
437 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0336  hypothetical protein  62.18 
 
 
431 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.673936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2506  recombination factor protein RarA  63.53 
 
 
437 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1743  recombination factor protein RarA  63.24 
 
 
437 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2547  recombination factor protein RarA  61.73 
 
 
452 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.135432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0788  recombination factor protein RarA  62.56 
 
 
442 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1668  AAA ATPase central domain protein  59.86 
 
 
463 aa  525  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0287351  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0288  recombination factor protein RarA  62.16 
 
 
443 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0621  recombination factor protein RarA  60.82 
 
 
436 aa  524  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1651  recombination factor protein RarA  62.21 
 
 
433 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2156  recombination factor protein RarA  59.91 
 
 
439 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.562236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0163  recombination factor protein RarA  61.93 
 
 
444 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1767  recombination factor protein RarA  61.47 
 
 
435 aa  499  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.797649  normal  0.255961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0497  recombination factor protein RarA  60.33 
 
 
473 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  53.52 
 
 
447 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 
459 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  54.11 
 
 
461 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  51.47 
 
 
441 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.92 
 
 
440 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  52.33 
 
 
440 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  53.61 
 
 
440 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  52.6 
 
 
441 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 
441 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  52.6 
 
 
441 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  51.47 
 
 
441 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.24 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  51.69 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  51.47 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 
447 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1651  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 
444 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0230087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
453 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 
505 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  46.67 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  47.75 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  47.94 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  47.25 
 
 
440 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  48.05 
 
 
457 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  47.71 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.47 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.48 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1728  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 
434 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  47.81 
 
 
435 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1728  recombination factor protein RarA  47.95 
 
 
434 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 
447 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 
443 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0938  recombination factor protein RarA  48.75 
 
 
436 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  50.93 
 
 
451 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  47.47 
 
 
447 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 
435 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0849  recombination factor protein RarA  48.98 
 
 
436 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276408  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0837  recombination factor protein RarA  48.98 
 
 
436 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0954108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  51.42 
 
 
444 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  47.42 
 
 
443 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 
435 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 
455 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1298  recombination factor protein RarA  48.72 
 
 
437 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.795117  normal  0.498089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0641  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 
453 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5359  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
434 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144347  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3436  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 
437 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0498  recombination factor protein RarA  48.53 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0977  recombination factor protein RarA  48.53 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  48.67 
 
 
443 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>