262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0117 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0117  3'-5' exonuclease family protein  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0120  3'-5' exonuclease family protein  99.51 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0135  3'-5' exonuclease  95.61 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3984  3'-5' exonuclease  77.56 
 
 		 205 aa  344  5e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1219  3'-5' exonuclease domain-containing protein  78.54 
 
 		 206 aa  330  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0419  3'-5' exonuclease  70.24 
 
 		 204 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0179  3'-5' exonuclease  66.99 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00803697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0174  3'-5' exonuclease  68.78 
 
 		 204 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3464  3'-5' exonuclease  70.24 
 
 		 208 aa  293  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0659  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 		 204 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.265112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4028  3'-5' exonuclease  69.27 
 
 		 208 aa  291  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0047  3'-5' exonuclease  67.32 
 
 		 204 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0120  ribonuclease D  67.8 
 
 		 208 aa  288  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.818192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0171  3'-5' exonuclease  66.5 
 
 		 206 aa  287  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4358  3'-5' exonuclease  68.29 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0125  putative 3'-5' exonuclease family protein  65.85 
 
 		 204 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00602859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0068  3'-5' exonuclease  66.18 
 
 		 206 aa  279  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2425  3'-5' exonuclease  66.5 
 
 		 209 aa  278  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2497  3'-5' exonuclease  65.02 
 
 		 209 aa  274  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325432  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0155  3'-5' exonuclease  62.25 
 
 		 204 aa  274  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.299764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5125  3'-5' exonuclease  65.37 
 
 		 207 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0268839  normal  0.933758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5275  3'-5' exonuclease  63.9 
 
 		 204 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2609  3'-5' exonuclease  64.56 
 
 		 204 aa  271  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0572  3'-5' exonuclease  62.44 
 
 		 204 aa  269  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2720  3'-5' exonuclease  64.53 
 
 		 209 aa  269  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.149721  normal  0.0609935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0027  3'-5' exonuclease  61.17 
 
 		 204 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.189554  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2775  3'-5' exonuclease  64.08 
 
 		 204 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3589  3'-5' exonuclease  62.44 
 
 		 203 aa  261  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0228  3'-5' exonuclease  60 
 
 		 203 aa  260  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5922  3'-5' exonuclease  61.95 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2813  3'-5' exonuclease  63.11 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1152  ribonuclease D  62.93 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0196  3'-5' exonuclease  57.84 
 
 		 203 aa  253  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0015  3'-5' exonuclease  59.61 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2343  3'-5' exonuclease  58.74 
 
 		 205 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0109  3'-5' exonuclease  57.77 
 
 		 204 aa  242  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.378562  normal  0.35649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0333  3'-5' exonuclease  56.65 
 
 		 210 aa  237  9e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273167  normal  0.287022 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0816  3'-5' exonuclease  56.5 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00362431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2903  3'-5' exonuclease  56.59 
 
 		 205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.865613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3251  3'-5' exonuclease  57.07 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1669  3'-5' exonuclease  56.46 
 
 		 218 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.335885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1011  3'-5' exonuclease family protein  53.66 
 
 		 204 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0881939  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4954  3'-5' exonuclease  55.22 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.332898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0878  3'-5' exonuclease  53.4 
 
 		 206 aa  227  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0529  3'-5' exonuclease family protein  52.26 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0327  3'-5' exonuclease  52.97 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2509  3'-5' exonuclease  51.52 
 
 		 209 aa  194  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3799  3'-5' exonuclease  50.26 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1621  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.169628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1914  3'-5' exonuclease  50 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0678  3'-5' exonuclease  49.74 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1147  3'-5' exonuclease  50.54 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1118  3'-5' exonuclease  50.54 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17051  putative ribonuclease D  50.54 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2246  3'-5' exonuclease  48.13 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17711  putative ribonuclease D  45.15 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1676  putative ribonuclease D  47.62 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17761  putative ribonuclease D  46.04 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1922  3'-5' exonuclease  46.93 
 
 		 214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0431536  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0407  3'-5' exonuclease  46.49 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.23143  normal  0.475558 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17921  putative ribonuclease D  45.95 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20321  putative ribonuclease D  47.31 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1157  putative ribonuclease D  46.77 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22631  putative ribonuclease D  48.82 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1164  3'-5' exonuclease  38.41 
 
 		 550 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0638405  normal  0.521406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  35.26 
 
 		 388 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  36.36 
 
 		 393 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  36.94 
 
 		 392 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  35.15 
 
 		 399 aa  89  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  30.3 
 
 		 389 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  29.71 
 
 		 385 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  31.82 
 
 		 405 aa  85.5  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  29.71 
 
 		 385 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  33.53 
 
 		 375 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  29.71 
 
 		 385 aa  85.1  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  32.94 
 
 		 381 aa  84.7  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1337  ribonuclease D  30.38 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118451  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  28.9 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  34.42 
 
 		 396 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  31.17 
 
 		 395 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4526  ribonuclease D  31.33 
 
 		 394 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780043  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  29.71 
 
 		 381 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0703  3'-5' exonuclease  30.91 
 
 		 386 aa  81.3  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.807909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0186  ribonuclease D, putative  29.49 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  30.97 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5131  ribonuclease D  30.2 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  29.7 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  31.54 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  28 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  31.54 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  30.68 
 
 		 386 aa  78.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1887  putative ribonuclease D  28.48 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0137487  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3039  ribonuclease D  30.87 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  33.12 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0300  putative ribonuclease D  30.77 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  28.32 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.56 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  33.55 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  33.55 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  30.51 
 
 		 583 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>