62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3070 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  97.04 
 
 		 464 aa  330  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  97.04 
 
 		 515 aa  329  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  95.86 
 
 		 464 aa  328  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  89.94 
 
 		 429 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  81.1 
 
 		 423 aa  275  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  82.04 
 
 		 428 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  82.04 
 
 		 428 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  80.36 
 
 		 428 aa  275  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  82.04 
 
 		 428 aa  275  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  81.07 
 
 		 428 aa  273  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  79.76 
 
 		 428 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  82.8 
 
 		 425 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  82.58 
 
 		 422 aa  270  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  81.7 
 
 		 424 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  50.33 
 
 		 424 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  50.33 
 
 		 424 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  49.01 
 
 		 424 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  48.34 
 
 		 424 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  48.34 
 
 		 424 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  47.68 
 
 		 424 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  47.68 
 
 		 424 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  46.67 
 
 		 424 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  46.94 
 
 		 436 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  46.26 
 
 		 436 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  40.61 
 
 		 429 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  51.45 
 
 		 424 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  50.72 
 
 		 424 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  50.72 
 
 		 422 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  50.72 
 
 		 422 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  50.72 
 
 		 422 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  50.72 
 
 		 422 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  50.72 
 
 		 424 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  42.86 
 
 		 419 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  43.62 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  33.99 
 
 		 427 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  34 
 
 		 441 aa  87  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  38.81 
 
 		 411 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.75 
 
 		 780 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  28.03 
 
 		 428 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  37.93 
 
 		 421 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.18 
 
 		 790 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  35.77 
 
 		 426 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 		 426 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 		 426 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  34.81 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  37.38 
 
 		 426 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  35.51 
 
 		 426 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.79 
 
 		 777 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  35.07 
 
 		 423 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  34.74 
 
 		 403 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  34.74 
 
 		 427 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  34.74 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  29.52 
 
 		 424 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  35.79 
 
 		 427 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  30.86 
 
 		 440 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  29.63 
 
 		 446 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  22.88 
 
 		 414 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  24.11 
 
 		 413 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>