More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2848 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  99.81 
 
 
533 aa  1088  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  99.81 
 
 
533 aa  1087  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  86.53 
 
 
525 aa  914  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0001  chromosomal replication initiation protein  85.21 
 
 
518 aa  895  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470324 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0001  chromosomal replication initiation protein  99.81 
 
 
518 aa  1055  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  85.79 
 
 
525 aa  901  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
533 aa  1090  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0001  chromosomal replication initiation protein  94.24 
 
 
545 aa  731  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0001  chromosomal replication initiation protein  74.4 
 
 
529 aa  786  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0001  chromosomal replication initiation protein  66.16 
 
 
584 aa  751  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  86.54 
 
 
525 aa  893  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0001  chromosomal replication initiation protein  74.86 
 
 
529 aa  785  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  95.34 
 
 
536 aa  942  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  85.64 
 
 
524 aa  903  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  1.95718e-05 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  99.81 
 
 
533 aa  1087  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  69.19 
 
 
579 aa  771  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0001  chromosomal replication initiation protein  86.53 
 
 
525 aa  914  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.375862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4462  chromosomal replication initiation protein  93.98 
 
 
544 aa  729  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369414  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  85.79 
 
 
525 aa  906  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.54964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  64.08 
 
 
475 aa  679  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  99.81 
 
 
533 aa  1088  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3442  chromosomal replication initiation protein  73.8 
 
 
522 aa  777  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807856  normal  0.719643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
533 aa  1090  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2553  chromosomal replication initiation protein  85.79 
 
 
561 aa  902  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  85.26 
 
 
474 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0001  chromosomal replication initiation protein  56.69 
 
 
459 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0624121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0001  chromosomal replication initiation protein  55.51 
 
 
467 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.720821  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0001  chromosomal replication initiation protein  53.38 
 
 
500 aa  548  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4144  chromosomal replication initiation protein  74.34 
 
 
473 aa  541  1e-152  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0001  chromosomal replication initiation protein  74.63 
 
 
475 aa  541  1e-152  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.738182  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0001  chromosomal replication initiation protein  72.65 
 
 
468 aa  540  1e-152  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0688864  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0001  chromosomal replication initiation protein  53 
 
 
476 aa  541  1e-152  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0001  chromosomal replication initiation protein  74.34 
 
 
473 aa  541  1e-152  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0001  chromosomal replication initiation protein  74.34 
 
 
510 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.51615e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0001  chromosomal replication initiation protein  71.55 
 
 
464 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.789649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.26 
 
 
470 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.33107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4117  chromosomal replication initiation protein  73.2 
 
 
465 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  9.31933e-05  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0001  chromosomal replication initiation protein  70.39 
 
 
483 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0001  chromosomal replication initiation protein  51.12 
 
 
465 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.0295e-06  decreased coverage  0.002869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0001  chromosomal replication initiation protein  74.04 
 
 
470 aa  516  1e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  8.52444e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  48.98 
 
 
524 aa  492  1e-138  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  50.79 
 
 
495 aa  489  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  68.25 
 
 
457 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
462 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.11976e-10  n/a   
 
 
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  49.72 
 
 
511 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  47.16 
 
 
461 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.63579e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
462 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.62887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.25 
 
 
464 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
462 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.57358e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
462 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.98931e-09  unclonable  3.43779e-12 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
455 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
462 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.57699e-06  unclonable  1.21376e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  47.73 
 
 
460 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81375e-07  unclonable  6.00935e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  47.35 
 
 
461 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.3 
 
 
462 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  47.54 
 
 
460 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.79736e-07  unclonable  3.13535e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  47.73 
 
 
461 aa  475  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.02323e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  50.09 
 
 
510 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  48.49 
 
 
465 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  47.73 
 
 
460 aa  478  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  47.54 
 
 
460 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.24276e-06  unclonable  1.76e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  48.77 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.02031e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  48.87 
 
 
478 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.77 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.36922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  48.77 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  46.79 
 
 
451 aa  472  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  7.64641e-07  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  48.77 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.26813e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  48.77 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  48.77 
 
 
467 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.01887e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  47.16 
 
 
462 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.81438e-07  unclonable  1.18337e-08 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  48.77 
 
 
467 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  48.77 
 
 
467 aa  471  1e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  49.25 
 
 
512 aa  469  1e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  47.73 
 
 
472 aa  470  1e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.51721e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  48.2 
 
 
467 aa  471  1e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  5.58594e-06  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  46.59 
 
 
462 aa  465  1e-130  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  unclonable  1.36332e-10 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  48.02 
 
 
514 aa  467  1e-130  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  47.07 
 
 
468 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  5.52796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  47.07 
 
 
468 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.4 
 
 
474 aa  459  1e-128  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  47.92 
 
 
465 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  45.56 
 
 
533 aa  454  1e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  9.17685e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.9 
 
 
455 aa  447  1e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  60.46 
 
 
459 aa  447  1e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.81636e-06  unclonable  3.44978e-06 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  57.44 
 
 
450 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.34969e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  61.42 
 
 
457 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.24276e-07  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.61 
 
 
461 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  61.1 
 
 
462 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  61.1 
 
 
462 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  61.72 
 
 
466 aa  438  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.44177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  61.9 
 
 
506 aa  440  1e-122  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  3.64152e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  61.72 
 
 
466 aa  438  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.62 
 
 
511 aa  441  1e-122  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  61.72 
 
 
466 aa  438  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  61.72 
 
 
466 aa  438  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  61.72 
 
 
463 aa  439  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  61.72 
 
 
466 aa  438  1e-122  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.53 
 
 
469 aa  439  1e-122  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0001  chromosomal replication initiation protein  47.09 
 
 
487 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  1.89853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.72 
 
 
483 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.28329e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>