More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2655 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  88.54 
 
 
421 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  99.76 
 
 
420 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  99.76 
 
 
420 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  87.83 
 
 
421 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  81.58 
 
 
419 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  97.14 
 
 
420 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  83.29 
 
 
419 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  87.62 
 
 
420 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  88.07 
 
 
421 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  99.76 
 
 
420 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  87.62 
 
 
420 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  88.07 
 
 
421 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  88.07 
 
 
421 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  83.29 
 
 
419 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 
420 aa  839    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  63.79 
 
 
417 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  65.23 
 
 
465 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  65.47 
 
 
465 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  66.35 
 
 
425 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  64.2 
 
 
466 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  58.6 
 
 
420 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.93 
 
 
418 aa  449  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  60.29 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.81 
 
 
465 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  55.48 
 
 
519 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  57.21 
 
 
425 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.97 
 
 
425 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  56.53 
 
 
423 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  57.31 
 
 
424 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  57.25 
 
 
447 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.38 
 
 
470 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.42 
 
 
417 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  56.62 
 
 
429 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  54.46 
 
 
417 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  53.47 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  55.11 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  56.72 
 
 
415 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  51.2 
 
 
423 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.9 
 
 
478 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  43.19 
 
 
434 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.37 
 
 
426 aa  260  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.49 
 
 
433 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  38.35 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  41.2 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3469  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.54 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  41.9 
 
 
433 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  40.43 
 
 
434 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  39.71 
 
 
433 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  41.37 
 
 
434 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  36.38 
 
 
449 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.12 
 
 
429 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.68 
 
 
460 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.01 
 
 
437 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  38.57 
 
 
432 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.5 
 
 
432 aa  227  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.49 
 
 
451 aa  226  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  42.37 
 
 
427 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  34.2 
 
 
412 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  40.25 
 
 
448 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1326  Fmu (Sun) domain protein  37.76 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.11 
 
 
443 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  33.79 
 
 
410 aa  220  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.92 
 
 
404 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  39.15 
 
 
427 aa  216  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4316  Fmu (Sun) domain protein  35.62 
 
 
429 aa  216  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2543  Fmu (Sun)  37.62 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.68 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  34.55 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  37.78 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.7 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1921  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.06 
 
 
430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0087  Fmu (Sun) domain-containing protein  43.98 
 
 
370 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.92 
 
 
448 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4579  Fmu (Sun) domain protein  35.93 
 
 
429 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  32.63 
 
 
403 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.19 
 
 
448 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  39.18 
 
 
446 aa  209  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  37.46 
 
 
449 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  32.45 
 
 
452 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  34.16 
 
 
446 aa  206  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.94 
 
 
452 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.19 
 
 
448 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2215  sun protein, putative  35.66 
 
 
404 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  33.93 
 
 
429 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.29 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.05 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  34.64 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  33.63 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.82 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1178  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.7 
 
 
437 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0995353  normal  0.6994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0966  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.04 
 
 
437 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.93 
 
 
416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2041  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.34 
 
 
404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4571  hypothetical protein  35.1 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2285  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.1 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2297  Fmu (Sun) domain protein  35.1 
 
 
404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000974746  normal  0.583601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2088  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.1 
 
 
404 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>