More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2581 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  100 
 
 
209 aa  426  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  100 
 
 
224 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  100 
 
 
224 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  100 
 
 
224 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  100 
 
 
224 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  100 
 
 
224 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  98.56 
 
 
224 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  90.31 
 
 
222 aa  343  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  89.8 
 
 
222 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  89.8 
 
 
222 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  89.74 
 
 
222 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  89.23 
 
 
222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  89.23 
 
 
222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  89.23 
 
 
222 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  84.46 
 
 
215 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  83.94 
 
 
215 aa  323  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  87.7 
 
 
215 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  67.01 
 
 
217 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  65.48 
 
 
218 aa  250  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  65.48 
 
 
218 aa  250  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  66.67 
 
 
218 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  64.97 
 
 
218 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  54.55 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  54.55 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  57.62 
 
 
219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  55.67 
 
 
219 aa  210  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  50.98 
 
 
210 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  50.24 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  51.78 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  52.04 
 
 
212 aa  185  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  57.22 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.05 
 
 
242 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  47.3 
 
 
232 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  48.45 
 
 
187 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  45.83 
 
 
225 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  52.81 
 
 
219 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  52.81 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  44.85 
 
 
188 aa  168  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  39.73 
 
 
243 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  52.67 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  52.67 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  52.67 
 
 
354 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  52.67 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  52.67 
 
 
358 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  52.67 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  52.67 
 
 
365 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  52.67 
 
 
350 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  52.67 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  53.44 
 
 
351 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  51.39 
 
 
353 aa  138  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  51.39 
 
 
353 aa  138  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  51.39 
 
 
357 aa  138  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  51.15 
 
 
369 aa  138  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  50.38 
 
 
358 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  50.38 
 
 
358 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  50.38 
 
 
371 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  50.38 
 
 
369 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  50.39 
 
 
355 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  51.94 
 
 
354 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  54.76 
 
 
387 aa  134  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  51.94 
 
 
361 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  51.94 
 
 
366 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2253  OmpA/MotB domain protein  51.59 
 
 
373 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.133607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  48.09 
 
 
358 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.1 
 
 
607 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1488  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  39.16 
 
 
298 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2907  OmpA/MotB family outer membrane protein  49.65 
 
 
372 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0305  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  37.95 
 
 
276 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.519947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1323  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  37.95 
 
 
271 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0581  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  37.95 
 
 
276 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2507  OmpA family protein  38.18 
 
 
252 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1248  ompA family protein  37.95 
 
 
276 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1321  ompA family protein  37.95 
 
 
276 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590791  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0986  OmpA/SmpA/OmlA family outer membrane lipoprotein  37.95 
 
 
276 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  44.52 
 
 
363 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  48.31 
 
 
278 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6867  OmpA/MotB domain protein  48.97 
 
 
371 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301365  normal  0.329522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  38.34 
 
 
355 aa  112  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5561  OmpA/MotB domain protein  44.87 
 
 
276 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  44.35 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1591  OmpA family outer membrane protein  45.08 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  45.08 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1362  ompA family protein  44.26 
 
 
236 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0841  ompA family protein  44.26 
 
 
223 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0644  ompA family protein  44.26 
 
 
236 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.544192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0512  ompA family protein  44.26 
 
 
236 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.93 
 
 
609 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  45.16 
 
 
376 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 
207 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6884  OmpA/MotB domain protein  42.25 
 
 
362 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177157  normal  0.158984 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.86 
 
 
235 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2929  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 
359 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  42.31 
 
 
830 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5847  OmpA/MotB:SmpA/OmlA  36.59 
 
 
292 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  41.6 
 
 
831 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  41.6 
 
 
831 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  43.2 
 
 
831 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.66 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  36.99 
 
 
290 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>