More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2349 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  98.72 
 
 
313 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  95.53 
 
 
313 aa  613  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  95.53 
 
 
313 aa  613  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  94.57 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  94.89 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  93.93 
 
 
313 aa  604  1e-172  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 
313 aa  577  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  89.78 
 
 
313 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  90.1 
 
 
313 aa  577  1e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  76.04 
 
 
313 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 
313 aa  491  1e-138  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  73.8 
 
 
313 aa  491  1e-138  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  73.48 
 
 
313 aa  491  1e-138  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  73.16 
 
 
313 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  67.41 
 
 
313 aa  459  1e-128  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  58.47 
 
 
313 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  58.47 
 
 
313 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  57.19 
 
 
313 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  57.64 
 
 
314 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  57.51 
 
 
326 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1721  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 
313 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  56.11 
 
 
317 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1917  transcriptional regulator CysB-like protein  56.87 
 
 
313 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.832664  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  58.17 
 
 
311 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  57.01 
 
 
314 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
308 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  55.84 
 
 
312 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  55.73 
 
 
321 aa  362  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  54.1 
 
 
308 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 
308 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  55.41 
 
 
308 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  55.07 
 
 
308 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  53.77 
 
 
308 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  53.57 
 
 
308 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  54.25 
 
 
313 aa  357  2e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  53.55 
 
 
354 aa  355  4e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  57.52 
 
 
314 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  54.93 
 
 
308 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  52.79 
 
 
312 aa  345  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2112  transcriptional regulator CysB-like protein  56.56 
 
 
317 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 
311 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  52.6 
 
 
309 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  51.64 
 
 
320 aa  342  6e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 
320 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 
320 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  54.37 
 
 
314 aa  337  1e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  50.97 
 
 
314 aa  337  2e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.79611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 
309 aa  336  4e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  52.3 
 
 
319 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  53.23 
 
 
315 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  52.6 
 
 
316 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  50.99 
 
 
306 aa  332  7e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  51.97 
 
 
319 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  51.97 
 
 
327 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  48.85 
 
 
326 aa  325  8e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 
308 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  47.04 
 
 
323 aa  308  1e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  46.89 
 
 
333 aa  307  2e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  46.05 
 
 
324 aa  299  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  46.05 
 
 
324 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  1.81404e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  46.05 
 
 
324 aa  299  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  46.05 
 
 
324 aa  299  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  44.59 
 
 
324 aa  298  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  46.71 
 
 
324 aa  297  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1857  transcriptional regulator CysB  45.6 
 
 
327 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00369362  decreased coverage  2.17707e-09 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  46.62 
 
 
316 aa  296  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.65107e-08  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2487  transcriptional regulator CysB  45.6 
 
 
327 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343529  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2494  transcriptional regulator CysB  45.6 
 
 
327 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2607  transcriptional regulator CysB  45.6 
 
 
327 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00558949  decreased coverage  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  44.41 
 
 
324 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  46.28 
 
 
316 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.01541e-08  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  43.13 
 
 
325 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  45.08 
 
 
323 aa  294  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  44.92 
 
 
325 aa  292  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  44.13 
 
 
324 aa  292  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  45.07 
 
 
324 aa  292  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  44.92 
 
 
324 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  44.26 
 
 
324 aa  290  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  44.26 
 
 
324 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>