More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2180 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  97.67 
 
 
300 aa  596  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  88.67 
 
 
301 aa  550  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  88.67 
 
 
301 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  88.33 
 
 
301 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 
301 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  88 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  84.18 
 
 
320 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  85.71 
 
 
302 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  83.5 
 
 
308 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  75.68 
 
 
294 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  75.68 
 
 
294 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  74.23 
 
 
294 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  74.57 
 
 
319 aa  448  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  73.2 
 
 
294 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  68.97 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  67.93 
 
 
293 aa  410  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  65.98 
 
 
298 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  65.98 
 
 
298 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  66.55 
 
 
292 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  65.54 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  63.3 
 
 
298 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  65.31 
 
 
307 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  64.65 
 
 
298 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  63.85 
 
 
323 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  63.45 
 
 
290 aa  388  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  64.04 
 
 
296 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  63.92 
 
 
321 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  62.98 
 
 
296 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  63.57 
 
 
296 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  63.67 
 
 
292 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  61.72 
 
 
292 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  63.67 
 
 
290 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  63.67 
 
 
290 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  61.38 
 
 
292 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  64.16 
 
 
300 aa  361  7.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 
292 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 
292 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  60.41 
 
 
295 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 
292 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  60.69 
 
 
291 aa  358  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  59.73 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  59.73 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  60.21 
 
 
287 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  57.93 
 
 
293 aa  348  5e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 
292 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  59.66 
 
 
292 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  58.42 
 
 
292 aa  338  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  55.52 
 
 
294 aa  337  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  56.75 
 
 
294 aa  331  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 
292 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  53.49 
 
 
302 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  54.48 
 
 
291 aa  324  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  55.56 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  55.28 
 
 
286 aa  318  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  54.64 
 
 
301 aa  311  6.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 
300 aa  308  5e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  53.61 
 
 
301 aa  304  9.000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
291 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  53.31 
 
 
291 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  51.2 
 
 
293 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  51.9 
 
 
292 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  51.9 
 
 
292 aa  298  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
294 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
294 aa  296  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
294 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  51.39 
 
 
294 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  51.56 
 
 
292 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 
296 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
300 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  51.8 
 
 
294 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  51.8 
 
 
294 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
289 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  49.13 
 
 
297 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  51.8 
 
 
294 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  51.8 
 
 
294 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 
294 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  55.38 
 
 
300 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 
290 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 
292 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
292 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  49.48 
 
 
292 aa  290  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 
292 aa  290  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 
292 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>