124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2008 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  100 
 
 
280 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  98.93 
 
 
280 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  100 
 
 
327 aa  500  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  100 
 
 
318 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  97.54 
 
 
287 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  92.18 
 
 
279 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  91.16 
 
 
263 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  91.16 
 
 
263 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  91.36 
 
 
278 aa  454  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  91.36 
 
 
263 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  91.36 
 
 
263 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  92.53 
 
 
278 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  87.6 
 
 
285 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  81.89 
 
 
288 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  84.38 
 
 
288 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  66.53 
 
 
245 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  63.22 
 
 
244 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  64.32 
 
 
261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  61.57 
 
 
245 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  61.02 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  54.96 
 
 
243 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  57.26 
 
 
234 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  56.09 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  52.48 
 
 
243 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  52.48 
 
 
243 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.63 
 
 
245 aa  244  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  52.08 
 
 
247 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  52.24 
 
 
243 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.21 
 
 
244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.79 
 
 
245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  47.52 
 
 
243 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.61 
 
 
247 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.07 
 
 
253 aa  225  8e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.75 
 
 
247 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  51.03 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  47.39 
 
 
232 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  50.42 
 
 
243 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  49.57 
 
 
241 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  48.71 
 
 
236 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  47.74 
 
 
243 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  51.44 
 
 
258 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  57.07 
 
 
205 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  46.36 
 
 
220 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  46.36 
 
 
220 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  46.36 
 
 
220 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  38.02 
 
 
242 aa  148  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.17 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.17 
 
 
242 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  38.56 
 
 
240 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  39.09 
 
 
242 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  38.17 
 
 
242 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  38.17 
 
 
242 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.98 
 
 
240 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  38.98 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  38.98 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.14 
 
 
240 aa  138  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  38.14 
 
 
247 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  38.14 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  38.01 
 
 
239 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.91 
 
 
248 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  35.44 
 
 
249 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  35.59 
 
 
248 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  38.4 
 
 
258 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  35.44 
 
 
256 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.32 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  34.56 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.03 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.03 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  33.05 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  32.31 
 
 
245 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  35.32 
 
 
627 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  33.33 
 
 
245 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  31.78 
 
 
279 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  39.6 
 
 
220 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  33.5 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  38.73 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.2 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  27.48 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  27.03 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  34.45 
 
 
212 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  38.64 
 
 
205 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.54 
 
 
226 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.75 
 
 
250 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6268  Asp/Glu/hydantoin racemase  26.32 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.08 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.31 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  29.27 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.12 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.75 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  34.29 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  30.91 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  29.77 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  31.28 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2261  racemase, putative  30.63 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113318  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  27.54 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  28.17 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  27.01 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  30.1 
 
 
213 aa  62  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>