More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0344 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  100 
 
 
105 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  100 
 
 
105 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  100 
 
 
105 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  100 
 
 
105 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  97.14 
 
 
105 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  97.14 
 
 
105 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  97.14 
 
 
105 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  79.05 
 
 
105 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  79.05 
 
 
105 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  78.1 
 
 
105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  78.1 
 
 
105 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  78.1 
 
 
105 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  77.14 
 
 
105 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  77.14 
 
 
105 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  76.19 
 
 
105 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  76.19 
 
 
105 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  77.14 
 
 
105 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 
96 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
96 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 
96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  60 
 
 
95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 
96 aa  130  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  58.33 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  60 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 
96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  56.25 
 
 
96 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 
96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  60 
 
 
96 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
96 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
127 aa  124  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 
96 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
95 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 
96 aa  123  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 
96 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
97 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
96 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
96 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 
96 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 
96 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
96 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
96 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
96 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
96 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  55.79 
 
 
95 aa  120  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 
96 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
96 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  51.43 
 
 
104 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
96 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
95 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
96 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  51.06 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
95 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  51.92 
 
 
104 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1939  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 
96 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>