175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0056 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  60.81 
 
 
616 aa  767    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  78.92 
 
 
611 aa  1006    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  54.06 
 
 
610 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  99.84 
 
 
612 aa  1239    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  78.59 
 
 
611 aa  1003    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  96.57 
 
 
612 aa  1195    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  78.27 
 
 
611 aa  1001    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  78.59 
 
 
611 aa  1003    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  79.08 
 
 
611 aa  1005    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  78.27 
 
 
611 aa  1001    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  78.27 
 
 
611 aa  1001    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  79.25 
 
 
612 aa  1028    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1241    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1241    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  99.51 
 
 
612 aa  1236    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  99.84 
 
 
612 aa  1239    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  57.42 
 
 
611 aa  706    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  47.87 
 
 
605 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  47.87 
 
 
605 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  47.87 
 
 
605 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  46.55 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  46.2 
 
 
660 aa  505  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  45.66 
 
 
616 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  45.66 
 
 
616 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  45.66 
 
 
616 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  45.82 
 
 
616 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  45.82 
 
 
633 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  45.66 
 
 
633 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  43.44 
 
 
603 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  42.04 
 
 
626 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  44.05 
 
 
620 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  42.46 
 
 
603 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  40.91 
 
 
611 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  38.77 
 
 
610 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  38.96 
 
 
606 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  38.15 
 
 
606 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  38.8 
 
 
606 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  37.99 
 
 
606 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.29 
 
 
590 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.69 
 
 
590 aa  334  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  36.08 
 
 
605 aa  323  5e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  34.26 
 
 
589 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.09 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  34.51 
 
 
589 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  35.35 
 
 
597 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  35.84 
 
 
597 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  32.5 
 
 
609 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.88 
 
 
597 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  35.43 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  35.43 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  35.43 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  35.43 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.8 
 
 
624 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  32.52 
 
 
586 aa  282  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  34.94 
 
 
623 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  34.94 
 
 
623 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  35.59 
 
 
623 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  31.6 
 
 
628 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  32.36 
 
 
625 aa  280  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  34.94 
 
 
623 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  33.07 
 
 
619 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  34.08 
 
 
619 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  33.92 
 
 
619 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  33.65 
 
 
623 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  32.56 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.96 
 
 
593 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  31.47 
 
 
592 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.43 
 
 
630 aa  263  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  31.7 
 
 
630 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  32.56 
 
 
582 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  32.86 
 
 
629 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  32.9 
 
 
590 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  31.33 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  31.75 
 
 
629 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.61 
 
 
626 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  29.15 
 
 
607 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  31.3 
 
 
620 aa  244  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.33 
 
 
629 aa  243  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  30.11 
 
 
624 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  33 
 
 
587 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  29.37 
 
 
626 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  29.37 
 
 
626 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  29.37 
 
 
626 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  31.71 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  31.71 
 
 
629 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  33.65 
 
 
596 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  31.63 
 
 
629 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  31.63 
 
 
629 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  31.63 
 
 
629 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  31.63 
 
 
629 aa  238  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  31.71 
 
 
629 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  30.33 
 
 
611 aa  238  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  30.11 
 
 
627 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  29.35 
 
 
629 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  28.18 
 
 
593 aa  231  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  29.48 
 
 
626 aa  230  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  30.11 
 
 
627 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  29.95 
 
 
627 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.25 
 
 
588 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  29.09 
 
 
626 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>