172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1713 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  100 
 
 
806 aa  1619    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  99.88 
 
 
806 aa  1617    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  91.19 
 
 
806 aa  1443    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  100 
 
 
806 aa  1619    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  100 
 
 
806 aa  1619    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  99.75 
 
 
806 aa  1615    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  99.88 
 
 
806 aa  1617    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  100 
 
 
806 aa  1619    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  44.77 
 
 
807 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  45.03 
 
 
805 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  45.03 
 
 
858 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  45.03 
 
 
800 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  44.77 
 
 
858 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  45.03 
 
 
800 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  44.64 
 
 
858 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  46.18 
 
 
1100 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  45 
 
 
1000 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  48.36 
 
 
638 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  38.15 
 
 
1567 aa  429  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  44.88 
 
 
1222 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  34.06 
 
 
593 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31.82 
 
 
918 aa  216  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  31.01 
 
 
781 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  30.81 
 
 
781 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  29.9 
 
 
797 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  27.95 
 
 
909 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  27.95 
 
 
947 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  30.1 
 
 
831 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  28.02 
 
 
759 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  33.45 
 
 
737 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  24.79 
 
 
517 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  36.77 
 
 
748 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  26.86 
 
 
672 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  27.56 
 
 
757 aa  92  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  24.47 
 
 
671 aa  88.6  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.84 
 
 
476 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.04 
 
 
794 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  36.23 
 
 
1016 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  35.76 
 
 
482 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.81 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.12 
 
 
436 aa  76.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  26.81 
 
 
963 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  26.05 
 
 
652 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  26.05 
 
 
652 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  35 
 
 
427 aa  72.8  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  36.29 
 
 
487 aa  72  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  31.65 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.23 
 
 
756 aa  70.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  24.34 
 
 
650 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  35.43 
 
 
943 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  26.56 
 
 
653 aa  68.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  26.15 
 
 
644 aa  67.8  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  38.89 
 
 
497 aa  67.8  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  32.41 
 
 
576 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.33 
 
 
461 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 
618 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  36.36 
 
 
451 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.32 
 
 
474 aa  66.6  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  26.98 
 
 
1207 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  34.46 
 
 
503 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  33.09 
 
 
1148 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  36.8 
 
 
186 aa  65.1  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  28.37 
 
 
884 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  32.54 
 
 
492 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.31 
 
 
489 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.88 
 
 
490 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  32.56 
 
 
1139 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  30.66 
 
 
368 aa  63.9  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  31.3 
 
 
239 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.1 
 
 
548 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  31.88 
 
 
430 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7940  hypothetical protein  29.27 
 
 
573 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  33.07 
 
 
401 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  32.82 
 
 
472 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  32.43 
 
 
691 aa  62  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.08 
 
 
1577 aa  61.6  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  34.19 
 
 
647 aa  61.6  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  32.77 
 
 
240 aa  61.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  33.58 
 
 
603 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  23.87 
 
 
450 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.1 
 
 
493 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.06 
 
 
535 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  27.89 
 
 
571 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.82 
 
 
500 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.59 
 
 
468 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  32.03 
 
 
801 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  33.86 
 
 
374 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  34.35 
 
 
380 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  32.82 
 
 
498 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.33 
 
 
520 aa  58.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  27.89 
 
 
412 aa  58.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  32.35 
 
 
1049 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  27.49 
 
 
957 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  30.94 
 
 
726 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.59 
 
 
493 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  23.57 
 
 
484 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  25.26 
 
 
366 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.37 
 
 
507 aa  57.4  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  33.61 
 
 
446 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  26 
 
 
466 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>