More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1511 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  99.66 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  99.66 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  99.66 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  97.28 
 
 
294 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  89.46 
 
 
294 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  89.12 
 
 
294 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  88.44 
 
 
294 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  88.1 
 
 
294 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  88.44 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  88.44 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  88.44 
 
 
294 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  86.39 
 
 
293 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  86.39 
 
 
293 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3949  polyprenyl synthetase  82.53 
 
 
291 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  72.41 
 
 
294 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  62.07 
 
 
297 aa  347  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0881  farnesyl-diphosphate synthase  72.07 
 
 
294 aa  341  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2427  Polyprenyl synthetase  66.22 
 
 
303 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2034  Polyprenyl synthetase  65.89 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2222  geranyltranstransferase  66.1 
 
 
299 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  61.09 
 
 
302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  57.04 
 
 
297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  63.23 
 
 
296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1633  geranyltranstransferase  55.1 
 
 
322 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0906165  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0218  geranyltranstransferase  55.1 
 
 
322 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1720  polyprenyl synthetase  55.1 
 
 
322 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0669938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  59.93 
 
 
306 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2132  farnesyl-diphosphate synthase  58.76 
 
 
296 aa  295  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.47194  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  53.45 
 
 
296 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  53.72 
 
 
300 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  61.51 
 
 
311 aa  291  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  63.92 
 
 
306 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  59.45 
 
 
327 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  58.5 
 
 
297 aa  286  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  60.55 
 
 
305 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  58.25 
 
 
298 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  57.53 
 
 
314 aa  278  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  52.76 
 
 
292 aa  276  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.53 
 
 
299 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  59.26 
 
 
316 aa  268  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  49.31 
 
 
291 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  49.32 
 
 
291 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1705  polyprenyl synthetase  53.82 
 
 
304 aa  262  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  50.85 
 
 
300 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  54.26 
 
 
295 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  50.86 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01897  polyprenyl synthetase  52.41 
 
 
291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.862425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  52.92 
 
 
295 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  53.98 
 
 
295 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  59.48 
 
 
314 aa  248  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  50.86 
 
 
295 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  52.94 
 
 
295 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  53.29 
 
 
295 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  53.29 
 
 
295 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  48.64 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  48.64 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1146  polyprenyl synthetase  50.52 
 
 
293 aa  245  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  52.6 
 
 
295 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1985  polyprenyl synthetase  55.63 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  53.82 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  52.94 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 
294 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2014  farnesyl-diphosphate synthase  60.42 
 
 
306 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319627  hitchhiker  0.00305409 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0098  farnesyl-diphosphate synthase  53.5 
 
 
285 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  48.23 
 
 
306 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  54.23 
 
 
295 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  54.61 
 
 
295 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  46.39 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  44.26 
 
 
297 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  45.95 
 
 
295 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  45.05 
 
 
300 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  46.05 
 
 
299 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  44.71 
 
 
299 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  52.48 
 
 
295 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  44.37 
 
 
300 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  44.84 
 
 
293 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  45.64 
 
 
299 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.95 
 
 
295 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  45.04 
 
 
293 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  56.44 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  44.71 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  50 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  42.41 
 
 
294 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  47.26 
 
 
306 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  46.98 
 
 
293 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  46.01 
 
 
293 aa  228  9e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  44.33 
 
 
293 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  43.97 
 
 
293 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  43.97 
 
 
293 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  43.97 
 
 
293 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  43.97 
 
 
293 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  46.98 
 
 
299 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  46.98 
 
 
299 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  46.44 
 
 
296 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  46.98 
 
 
299 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>