More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1309 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  85.97 
 
 
1017 aa  988  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  70.87 
 
 
927 aa  718  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  78.9 
 
 
921 aa  827  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  72.48 
 
 
921 aa  745  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  65.72 
 
 
912 aa  699  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  80.35 
 
 
927 aa  819  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  78.77 
 
 
918 aa  812  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  68.1 
 
 
908 aa  701  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  71.15 
 
 
911 aa  750  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  68.69 
 
 
930 aa  742  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  70.76 
 
 
911 aa  748  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  74.71 
 
 
930 aa  800  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  65.34 
 
 
912 aa  691  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  71.15 
 
 
911 aa  750  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  72.22 
 
 
925 aa  744  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  65.61 
 
 
917 aa  685  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  62.14 
 
 
932 aa  654  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  80.99 
 
 
936 aa  801  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  66.27 
 
 
911 aa  647  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  71.15 
 
 
911 aa  749  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  75.86 
 
 
919 aa  810  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  70.76 
 
 
911 aa  748  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  74.07 
 
 
901 aa  770  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  67.2 
 
 
901 aa  660  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  65.68 
 
 
909 aa  654  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  99.26 
 
 
1079 aa  2035  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  76.89 
 
 
936 aa  813  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  100 
 
 
1071 aa  2146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  97.86 
 
 
1066 aa  1993  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  65.56 
 
 
901 aa  649  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  71.18 
 
 
912 aa  737  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  71.09 
 
 
924 aa  743  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  65.55 
 
 
915 aa  659  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  74.11 
 
 
922 aa  806  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  73.03 
 
 
914 aa  765  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  65.19 
 
 
918 aa  698  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  69.02 
 
 
933 aa  755  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  64.76 
 
 
928 aa  658  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  66.41 
 
 
926 aa  714  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  74.04 
 
 
916 aa  738  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  70.47 
 
 
916 aa  753  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  97.15 
 
 
1089 aa  1986  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  70.96 
 
 
911 aa  749  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  65.76 
 
 
901 aa  650  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  100 
 
 
1071 aa  2146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  69.7 
 
 
994 aa  718  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  96.41 
 
 
1082 aa  1961  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  66.22 
 
 
943 aa  684  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  66.34 
 
 
912 aa  692  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  62.75 
 
 
920 aa  690  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  65.72 
 
 
912 aa  679  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.43 
 
 
913 aa  639  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  77.3 
 
 
936 aa  811  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  68.16 
 
 
922 aa  727  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  71.82 
 
 
911 aa  748  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  64.31 
 
 
907 aa  636  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  73.96 
 
 
930 aa  760  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  75.73 
 
 
927 aa  795  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  70.96 
 
 
911 aa  749  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  71.15 
 
 
911 aa  750  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  70.96 
 
 
911 aa  749  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  64.26 
 
 
935 aa  682  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.31 
 
 
913 aa  746  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.5 
 
 
913 aa  747  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  70.69 
 
 
913 aa  748  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  80.79 
 
 
942 aa  791  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  68.15 
 
 
904 aa  697  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  73.52 
 
 
929 aa  765  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  70.5 
 
 
913 aa  747  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  63.62 
 
 
916 aa  625  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  61.08 
 
 
942 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  58.14 
 
 
906 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  58.64 
 
 
906 aa  601  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  57.75 
 
 
906 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  57.75 
 
 
906 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.67 
 
 
914 aa  592  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.62 
 
 
651 aa  400  1e-110  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.86 
 
 
512 aa  361  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.44 
 
 
583 aa  356  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.15 
 
 
510 aa  354  6e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  38.9 
 
 
599 aa  348  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.48 
 
 
576 aa  345  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.45 
 
 
575 aa  337  8e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 
541 aa  336  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 
578 aa  325  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  36.94 
 
 
578 aa  325  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 
578 aa  324  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 
578 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  36.94 
 
 
578 aa  323  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  36.09 
 
 
579 aa  322  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36.53 
 
 
588 aa  315  2e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  36.06 
 
 
587 aa  292  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41514e-05 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 
551 aa  282  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  49.24 
 
 
594 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  44.79 
 
 
582 aa  236  2e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  47.62 
 
 
590 aa  232  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  45.12 
 
 
247 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
578 aa  229  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  45.45 
 
 
578 aa  229  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  47.22 
 
 
590 aa  229  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>