More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1211 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  100 
 
 
187 aa  359  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  100 
 
 
187 aa  359  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  98.93 
 
 
396 aa  341  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  98.4 
 
 
396 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  98.4 
 
 
396 aa  339  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  91.98 
 
 
396 aa  327  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  82.26 
 
 
392 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  82.26 
 
 
392 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  78.69 
 
 
397 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  81.62 
 
 
394 aa  283  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  75 
 
 
390 aa  269  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  77.42 
 
 
390 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  74.73 
 
 
401 aa  250  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  78.89 
 
 
390 aa  250  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  78.89 
 
 
390 aa  250  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  78.89 
 
 
390 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  77.65 
 
 
390 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  76.88 
 
 
401 aa  245  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  76.88 
 
 
401 aa  245  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  65.57 
 
 
398 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.47 
 
 
395 aa  217  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  69.46 
 
 
385 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  68.24 
 
 
382 aa  216  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  61.4 
 
 
393 aa  211  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.76 
 
 
392 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  69.32 
 
 
400 aa  204  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  68.75 
 
 
399 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.18 
 
 
404 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.58 
 
 
387 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.95 
 
 
379 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  37.11 
 
 
393 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.41 
 
 
391 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.15 
 
 
387 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  35.33 
 
 
376 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  37.8 
 
 
379 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.1 
 
 
393 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  35.29 
 
 
382 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  36.6 
 
 
389 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.71 
 
 
472 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.1 
 
 
386 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  36.53 
 
 
172 aa  97.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
472 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  32.52 
 
 
420 aa  97.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  41.84 
 
 
383 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  31.71 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  41.91 
 
 
388 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  36.64 
 
 
378 aa  91.7  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  31.74 
 
 
376 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  31.37 
 
 
376 aa  88.2  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  36.11 
 
 
417 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  30.82 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  34.32 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  32.57 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  31.72 
 
 
446 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  33.14 
 
 
453 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  34.92 
 
 
358 aa  81.3  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.39 
 
 
395 aa  80.9  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  34.45 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.57 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  34.44 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  35.61 
 
 
443 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  33.08 
 
 
412 aa  77.8  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  25.47 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  37.04 
 
 
450 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  35 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  33.08 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.53 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  37.04 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0728  Chromate transporter  33.86 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000950841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  31.82 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  34.62 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  33.08 
 
 
463 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1164  Chromate transporter  29.8 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  27.81 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  31.22 
 
 
442 aa  75.1  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  28.07 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  31.96 
 
 
456 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  30.67 
 
 
452 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  27.81 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  31.65 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  31.34 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  38.85 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  27.81 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  27.81 
 
 
175 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  27.27 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.04 
 
 
441 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.2 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  35.16 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  36.09 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  32.59 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.59 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  27.81 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  27.81 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  27.91 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  35.21 
 
 
456 aa  72.4  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0715  Chromate transporter  30.99 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  30.83 
 
 
483 aa  72  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.59 
 
 
441 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.19 
 
 
457 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.29 
 
 
386 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>