95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0925 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  332  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  99.4 
 
 
167 aa  331  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  99.4 
 
 
167 aa  331  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  99.4 
 
 
167 aa  331  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  67.27 
 
 
166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  62.5 
 
 
170 aa  204  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  64.78 
 
 
168 aa  203  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  58.08 
 
 
167 aa  196  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  61.64 
 
 
168 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  53.89 
 
 
167 aa  181  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  45.51 
 
 
172 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  45.45 
 
 
180 aa  140  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  45.45 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  45.45 
 
 
180 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  45 
 
 
163 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  45 
 
 
163 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  45 
 
 
163 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  45 
 
 
163 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  41.18 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  42.5 
 
 
179 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  39.63 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  39.63 
 
 
172 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  39.63 
 
 
172 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  39.63 
 
 
172 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  39.63 
 
 
179 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  39.63 
 
 
172 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  39.63 
 
 
172 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  39.19 
 
 
171 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  42.75 
 
 
172 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  43.61 
 
 
197 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  37.4 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  40.48 
 
 
154 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.77 
 
 
156 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  40.48 
 
 
154 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  40 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  43.81 
 
 
166 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  35.48 
 
 
199 aa  88.2  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  40.16 
 
 
160 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  43.69 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  43.69 
 
 
168 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  38.4 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  37.04 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  37.5 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  31.45 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  41.58 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  36.77 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  34.85 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  33.33 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  33.33 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  32.67 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  29.92 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.99 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  28.05 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.33 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  39.58 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  29.37 
 
 
156 aa  57.4  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  35 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  35.19 
 
 
292 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  31.21 
 
 
204 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  31.21 
 
 
204 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  25.21 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  31.43 
 
 
200 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  31.68 
 
 
181 aa  54.3  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  31.09 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  23.46 
 
 
251 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  32.41 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.68 
 
 
173 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.68 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  25.64 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  30.56 
 
 
189 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  27.78 
 
 
202 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  27.2 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  27.87 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  27.2 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  30.56 
 
 
212 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  28.12 
 
 
240 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  28.69 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  30.28 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  27.5 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  27.5 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  28.12 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  26.85 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  25.74 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  32.41 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  29.79 
 
 
202 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  31.19 
 
 
181 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  27.87 
 
 
193 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>