More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0868 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0868  major facilitator family protein  100 
 
 		 334 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1155  drug resistance transporter family protein  100 
 
 		 334 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0301  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 334 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0446618  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  99.1 
 
 		 582 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  99.4 
 
 		 553 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  91.62 
 
 		 587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  70.69 
 
 		 519 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  71.26 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  71.65 
 
 		 523 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  63.01 
 
 		 521 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  62.94 
 
 		 532 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  49.69 
 
 		 514 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.59 
 
 		 504 aa  237  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 510 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 511 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 574 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  33.65 
 
 		 519 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.64 
 
 		 525 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.8 
 
 		 522 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 538 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.42 
 
 		 516 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.59 
 
 		 469 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 530 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.25 
 
 		 543 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 541 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.69 
 
 		 527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 522 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  36.53 
 
 		 518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 		 584 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 506 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 509 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 516 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 489 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 512 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 512 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 516 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6604  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 512 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 529 aa  99  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 509 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 523 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 512 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  30 
 
 		 512 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  30 
 
 		 512 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  33.23 
 
 		 514 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 516 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 528 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 523 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 505 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 507 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 461 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 531 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 521 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 520 aa  90.1  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 		 534 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  31.8 
 
 		 521 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  30.32 
 
 		 554 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1007  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 536 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1024  major facilitator superfamily transporter  29.64 
 
 		 536 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 524 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 515 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1034  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 536 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1968  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 491 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.632276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.25 
 
 		 522 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 500 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  25.79 
 
 		 520 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 508 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 472 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5055  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 524 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 502 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 536 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  31.62 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2027  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 506 aa  83.2  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2542  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.33 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  30.57 
 
 		 502 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.65 
 
 		 525 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.9 
 
 		 515 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 510 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.39 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0354  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase alpha and beta subunits-like protein  26.13 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>