72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0750 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  99.36 
 
 
312 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  99.04 
 
 
312 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  99 
 
 
300 aa  593  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  86.22 
 
 
314 aa  535  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  27.02 
 
 
337 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  27.02 
 
 
337 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  27.02 
 
 
328 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  24.42 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  26.75 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.91 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.18 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  25.53 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  24.13 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  24.71 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  24.77 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  23.29 
 
 
372 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.37 
 
 
345 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  45.9 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  45.9 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  45.9 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  45.9 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  45.9 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  45.9 
 
 
359 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  22.89 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  45.9 
 
 
359 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  45.76 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  24.69 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  27.43 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  24.69 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  25.77 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  34.41 
 
 
356 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  34.41 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  34.41 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  47.06 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  37.31 
 
 
344 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  24.76 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  23.8 
 
 
368 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  34.33 
 
 
343 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  21.52 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  27.27 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.75 
 
 
345 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  34.43 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  26.32 
 
 
365 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.72 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  26.55 
 
 
393 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  26.55 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  26.55 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  32.95 
 
 
372 aa  45.8  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  25.27 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  25.27 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  25.27 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  25.08 
 
 
351 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  25.27 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  25.07 
 
 
366 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  25.95 
 
 
523 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  25.08 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  32 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  24.64 
 
 
357 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  34.18 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  39.58 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  21.57 
 
 
371 aa  42.7  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  32 
 
 
373 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>