234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0089 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  100 
 
 
353 aa  704    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  95.18 
 
 
353 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  92.35 
 
 
353 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  100 
 
 
353 aa  704    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  100 
 
 
353 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  99.15 
 
 
353 aa  696    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  95.47 
 
 
353 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  100 
 
 
353 aa  704    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  78.27 
 
 
347 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  78.27 
 
 
347 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  73.64 
 
 
353 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  77.74 
 
 
350 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  77.74 
 
 
353 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  77.44 
 
 
350 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  75.52 
 
 
347 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  66.47 
 
 
385 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  62.92 
 
 
380 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  63.64 
 
 
383 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  50.59 
 
 
403 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  47.54 
 
 
426 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  47.54 
 
 
426 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  48.24 
 
 
434 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  46.67 
 
 
417 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  50.14 
 
 
403 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  47.83 
 
 
420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  47.37 
 
 
423 aa  326  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  45.51 
 
 
425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  46.76 
 
 
437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.65 
 
 
427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  46.22 
 
 
414 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  51 
 
 
404 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  46.22 
 
 
414 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  51 
 
 
404 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  52.02 
 
 
402 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  52.48 
 
 
402 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  43.9 
 
 
414 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  44.57 
 
 
414 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  48.54 
 
 
403 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  48.44 
 
 
440 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  43.93 
 
 
414 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  48.99 
 
 
403 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  43.95 
 
 
433 aa  316  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  50.3 
 
 
421 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  46.69 
 
 
419 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  48.75 
 
 
400 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  44.12 
 
 
431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  44.41 
 
 
426 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  44.74 
 
 
417 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  42.2 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  44.57 
 
 
414 aa  308  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  42.77 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  44.87 
 
 
419 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  44.9 
 
 
418 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  44 
 
 
419 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  46.26 
 
 
432 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  46.11 
 
 
415 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  39.27 
 
 
405 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  40.35 
 
 
407 aa  258  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  41.6 
 
 
432 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  35.77 
 
 
444 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  35.77 
 
 
444 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  37.01 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  37.36 
 
 
430 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  37.36 
 
 
430 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.21 
 
 
669 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  37.75 
 
 
430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.35 
 
 
668 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.96 
 
 
438 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  36.93 
 
 
442 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  37.26 
 
 
423 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  35.04 
 
 
450 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  34.92 
 
 
467 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  35.24 
 
 
432 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  36.64 
 
 
443 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  38.27 
 
 
435 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  35.23 
 
 
437 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  35.04 
 
 
434 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  35.23 
 
 
437 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  35.13 
 
 
442 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  36.84 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  36.13 
 
 
425 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  35.67 
 
 
475 aa  195  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  38.04 
 
 
382 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  37.38 
 
 
392 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.99 
 
 
668 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.99 
 
 
668 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  37.86 
 
 
406 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  32.94 
 
 
397 aa  189  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  34.35 
 
 
370 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  32.96 
 
 
427 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  37.64 
 
 
403 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  32.12 
 
 
457 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  33.54 
 
 
462 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  33.52 
 
 
440 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.48 
 
 
410 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  33.82 
 
 
454 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.16 
 
 
668 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  29.37 
 
 
461 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  35.09 
 
 
454 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  33.54 
 
 
462 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>