27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0039 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0039  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0375  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1209  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1052  hypothetical protein  99.32 
 
 
151 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353773  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7329  hypothetical protein  58.09 
 
 
151 aa  166  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737619 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7314  hypothetical protein  45.26 
 
 
180 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.0516985 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6891  hypothetical protein  47.92 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6759  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0150  hypothetical protein  43.26 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7580  hypothetical protein  32.89 
 
 
167 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6753  hypothetical protein  35.82 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.694812  normal  0.562952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0104  hypothetical protein  33.58 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0235  transcriptional regulator, fis family  32.59 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5426  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4879  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288398  normal  0.359894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3251  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0635  hypothetical protein  29.93 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4717  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5555  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5305  hypothetical protein  30.87 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6576  hypothetical protein  35.77 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0143982  hitchhiker  0.00493463 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7514  hypothetical protein  29.37 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0891854  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4178  hypothetical protein  26.98 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44165  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2568  hypothetical protein  31.82 
 
 
133 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.756784 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6116  hypothetical protein  32.76 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.313869  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6534  hypothetical protein  28.07 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168837  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0221  transcriptional regulator, fis family  27.56 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>