39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0029 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1042  hypothetical protein  100 
 
 
588 aa  328  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0385  hypothetical protein  99.4 
 
 
699 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1199  hypothetical protein  99.4 
 
 
588 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0029  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0075  hypothetical protein  97.59 
 
 
700 aa  317  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.319032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1493  hypothetical protein  97.59 
 
 
584 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1578  hypothetical protein  97.59 
 
 
584 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211733  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1290  N-acyl-D-glutamate amidohydrolase  94.58 
 
 
584 aa  310  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2782  hypothetical protein  56.97 
 
 
598 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2796  hypothetical protein  56.97 
 
 
598 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282284  normal  0.995463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2752  hypothetical protein  56.97 
 
 
598 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12927  D-amino acid aminohydrolase  54.55 
 
 
611 aa  189  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1019  hypothetical protein  54.32 
 
 
587 aa  178  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3035  hypothetical protein  53.94 
 
 
604 aa  174  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3313  hypothetical protein  53.94 
 
 
339 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2936  hypothetical protein  44.44 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0420  hypothetical protein  38.89 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  37.65 
 
 
629 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4305  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.54 
 
 
494 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4195  N-acyl-D-amino-acid deacylase  30.54 
 
 
494 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1187  N-acyl-D-glutamate deacylase protein  31.74 
 
 
494 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.826213  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3345  amidohydrolase 3  36.62 
 
 
588 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.783036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3369  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
582 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559487  normal  0.377193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  29.93 
 
 
590 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3631  amidohydrolase 3  27.89 
 
 
580 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  31.97 
 
 
560 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3208  hypothetical protein  41.38 
 
 
79 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7586  dihydroorotase  32.17 
 
 
581 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1796  D-aminoacylase domain-containing protein  29.76 
 
 
560 aa  44.3  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.897442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5688  amidohydrolase 3  30.3 
 
 
586 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.496605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6853  amidohydrolase 3  29.27 
 
 
567 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130761  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3088  dihydroorotase  29.17 
 
 
570 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5309  amidohydrolase 3  30.3 
 
 
586 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5398  amidohydrolase 3  30.3 
 
 
586 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2206  Amidohydrolase 3  28.76 
 
 
601 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0568335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0561  amidohydrolase 3  28.48 
 
 
583 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2087  amidohydrolase 3  28.15 
 
 
577 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.72 
 
 
427 aa  41.6  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5252  hypothetical protein  29.2 
 
 
569 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>