30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0024 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0024  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.355297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1488  hypothetical protein  98.88 
 
 
170 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0831619  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1575  hypothetical protein  98.88 
 
 
170 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.622552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0388  hypothetical protein  98.88 
 
 
170 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1297  hypothetical protein  82.02 
 
 
208 aa  141  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336493  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6210  hypothetical protein  47.19 
 
 
169 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411943  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5878  hypothetical protein  46.07 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420141  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1900  hypothetical protein  42.05 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.561652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7034  hypothetical protein  39.29 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.814698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0631  hypothetical protein  31.71 
 
 
159 aa  60.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1001  hypothetical protein  34.88 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0156409  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1025  hypothetical protein  30.23 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.486494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1773  hypothetical protein  32.94 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00362767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1156  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5193  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1168  hypothetical protein  29.41 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1451  hypothetical protein  32.53 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.218216  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3267  hypothetical protein  24.71 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3353  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0417516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1226  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2357  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2316  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1951  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2474  hypothetical protein  31.76 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2826  hypothetical protein  32.94 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0379  hypothetical protein  21.84 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0993  hypothetical protein  23.53 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0230  hypothetical protein  26.74 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3351  hypothetical protein  25.88 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.878366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2125  hypothetical protein  29.41 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>