27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA2018 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  752    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  89.46 
 
 
371 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  99.73 
 
 
367 aa  741    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  99.73 
 
 
367 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  99.46 
 
 
367 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  99.73 
 
 
367 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  51.76 
 
 
381 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  52.47 
 
 
369 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  53.26 
 
 
378 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  53.53 
 
 
376 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  34.39 
 
 
235 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  32.85 
 
 
279 aa  113  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  34.62 
 
 
223 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  33.8 
 
 
235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 
235 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  29.11 
 
 
271 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  29.13 
 
 
277 aa  96.7  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4332  hypothetical protein  37.18 
 
 
191 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  32.89 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3576  hypothetical protein  34.81 
 
 
178 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.764191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  28.77 
 
 
152 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3873  hypothetical protein  36.52 
 
 
186 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.215319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>