More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1940 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
300 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 
338 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 
300 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  99.67 
 
 
300 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  97 
 
 
300 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  86 
 
 
300 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  84.67 
 
 
300 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  84.67 
 
 
300 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  84.67 
 
 
300 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  83.61 
 
 
300 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  84.28 
 
 
300 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  84.28 
 
 
300 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
306 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 
306 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  47.1 
 
 
310 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 
316 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
316 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
309 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
316 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
316 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
305 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
329 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
329 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
302 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 
318 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6961  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
320 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0795  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
316 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.556779 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.81 
 
 
298 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
320 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
317 aa  185  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
319 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 
301 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.68 
 
 
298 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.81 
 
 
298 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
307 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
302 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
332 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
318 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 
302 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
315 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.65 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  32.65 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  34.56 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
315 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.3 
 
 
302 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.3 
 
 
302 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
306 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
306 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
306 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 
296 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
342 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
306 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
302 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4296  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 
312 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3287  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5515  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4768  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3599  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601039  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5895  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
304 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0445545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  30.31 
 
 
302 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3565  DNA-binding transcriptional activator TdcA  26.76 
 
 
312 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
306 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 
331 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
320 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2998  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2701  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  26.01 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3086  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>