175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1904 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  60.82 
 
 
627 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  54.94 
 
 
626 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  75.36 
 
 
629 aa  985    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1266    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  65.39 
 
 
626 aa  858    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  54.94 
 
 
626 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  71.07 
 
 
629 aa  939    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  63.38 
 
 
626 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  99.68 
 
 
629 aa  1259    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  61.69 
 
 
626 aa  789    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  76.08 
 
 
629 aa  998    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  61.02 
 
 
639 aa  756    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  62.16 
 
 
626 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  62.9 
 
 
626 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  53.91 
 
 
637 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  71.27 
 
 
630 aa  937    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  65.66 
 
 
629 aa  846    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  60.98 
 
 
627 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  80.38 
 
 
629 aa  1041    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  60.66 
 
 
627 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1266    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  57.78 
 
 
628 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1266    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  54.94 
 
 
626 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  63.38 
 
 
626 aa  828    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  99.84 
 
 
629 aa  1262    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  52.93 
 
 
633 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  63.38 
 
 
626 aa  828    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  99.68 
 
 
629 aa  1260    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  59.3 
 
 
654 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  76.71 
 
 
629 aa  994    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  100 
 
 
629 aa  1266    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  53.08 
 
 
642 aa  631  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  48.89 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.75 
 
 
623 aa  555  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  48.89 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  48.89 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  48.89 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  48.89 
 
 
623 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  48.73 
 
 
623 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  48.73 
 
 
623 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  48.41 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  46.91 
 
 
623 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  48.01 
 
 
620 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  44.5 
 
 
628 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.47 
 
 
624 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  44.13 
 
 
624 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  44.29 
 
 
624 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  44.94 
 
 
619 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  45.25 
 
 
619 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  45.34 
 
 
619 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  43.3 
 
 
641 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  43.55 
 
 
638 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  40 
 
 
630 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  39.69 
 
 
625 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.08 
 
 
652 aa  321  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.28 
 
 
647 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.07 
 
 
605 aa  291  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  32.02 
 
 
611 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  32.55 
 
 
606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  32.92 
 
 
606 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  31.92 
 
 
606 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  32.29 
 
 
610 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  32.08 
 
 
606 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  32.6 
 
 
590 aa  276  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.02 
 
 
590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  34.63 
 
 
621 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  31.51 
 
 
612 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  31.35 
 
 
611 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  31.19 
 
 
611 aa  253  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  31.35 
 
 
611 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  31.35 
 
 
611 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  31.35 
 
 
611 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  31.19 
 
 
611 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.63 
 
 
621 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  33.69 
 
 
620 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  31.74 
 
 
612 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  34.09 
 
 
597 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  31.79 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  31.79 
 
 
612 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  31.94 
 
 
616 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.45 
 
 
589 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  31.63 
 
 
612 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  31.63 
 
 
612 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  30.93 
 
 
589 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  32.85 
 
 
597 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  31.47 
 
 
612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  30.55 
 
 
611 aa  243  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  32.9 
 
 
597 aa  240  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  31.44 
 
 
593 aa  237  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.86 
 
 
588 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  28.64 
 
 
588 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  27.94 
 
 
609 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  31.72 
 
 
611 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  28.32 
 
 
588 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  28.62 
 
 
588 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3561  type VI secretion protein  28.59 
 
 
614 aa  226  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0759  hypothetical protein  28.59 
 
 
614 aa  226  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.683588  normal  0.111342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3432  hypothetical protein  28.59 
 
 
614 aa  225  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  30.5 
 
 
587 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>