More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1325 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  100 
 
 
468 aa  925    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  100 
 
 
468 aa  925    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4698  major facilitator transporter  85.49 
 
 
466 aa  746    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.585046  normal  0.168682 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  67.95 
 
 
467 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  100 
 
 
468 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  69.23 
 
 
478 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  100 
 
 
474 aa  924    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  99.36 
 
 
468 aa  918    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3995  major facilitator transporter  84.62 
 
 
466 aa  742    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0613817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5602  major facilitator transporter  85.49 
 
 
466 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.610871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  99.79 
 
 
468 aa  923    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1116  major facilitator transporter  83.76 
 
 
466 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.10577  normal  0.134 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4557  major facilitator transporter  85.04 
 
 
466 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783301 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  94.66 
 
 
468 aa  823    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  69.87 
 
 
479 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  69.02 
 
 
467 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3669  major facilitator transporter  85.49 
 
 
466 aa  746    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4092  major facilitator transporter  84.83 
 
 
466 aa  765    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal  0.978075 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  100 
 
 
474 aa  924    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  65.78 
 
 
467 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  65.78 
 
 
467 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  41.78 
 
 
480 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  42.06 
 
 
480 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  42.06 
 
 
480 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  42.13 
 
 
480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  42.13 
 
 
480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
459 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  38.57 
 
 
463 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0632  general substrate transporter  38.66 
 
 
471 aa  303  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000142658  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 
485 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  36.31 
 
 
460 aa  292  8e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
461 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0909  major facilitator transporter  37.64 
 
 
455 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0703326  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  37.27 
 
 
434 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 
451 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  32.59 
 
 
447 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  33.41 
 
 
455 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  31.91 
 
 
455 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  33.62 
 
 
459 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 
451 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  32.54 
 
 
474 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.75 
 
 
478 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  32.25 
 
 
473 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  32.54 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  32.25 
 
 
474 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.81 
 
 
457 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.59 
 
 
472 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 
472 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.54 
 
 
478 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.54 
 
 
478 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.54 
 
 
478 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.54 
 
 
478 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.68 
 
 
478 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.54 
 
 
478 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  32.83 
 
 
476 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  32.06 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  31.98 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
470 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  32.68 
 
 
473 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 
467 aa  170  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.12 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.05 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  30.85 
 
 
456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.41 
 
 
399 aa  163  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  30.29 
 
 
461 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.47 
 
 
468 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  30.11 
 
 
399 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.67 
 
 
462 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  30.11 
 
 
399 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  30.63 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  30.39 
 
 
399 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  30.39 
 
 
399 aa  157  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  30.39 
 
 
399 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  30.39 
 
 
399 aa  156  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  30.39 
 
 
399 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  29.11 
 
 
464 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
399 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  29.7 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
473 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  30.8 
 
 
509 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.02 
 
 
468 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
466 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  29.17 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.44 
 
 
462 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
470 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
398 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1885  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
454 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
446 aa  142  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
458 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  26.98 
 
 
438 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.37 
 
 
449 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  26.8 
 
 
459 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
459 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>