More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA1189 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  97.55 
 
 
337 aa  636  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  95.04 
 
 
485 aa  811  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
550 aa  1093  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
331 aa  664  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
331 aa  664  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
342 aa  687  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  97.25 
 
 
337 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  89.86 
 
 
336 aa  612  1e-174  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  83 
 
 
600 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  84 
 
 
307 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  83 
 
 
313 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  82.67 
 
 
313 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  82.67 
 
 
313 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  83.73 
 
 
313 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  83.39 
 
 
313 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  53.45 
 
 
302 aa  309  9e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 
310 aa  308  2e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  50.17 
 
 
309 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  50.17 
 
 
309 aa  286  6e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  53.82 
 
 
321 aa  283  4e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  48.59 
 
 
313 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  33.09 
 
 
365 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  51.04 
 
 
279 aa  83.6  9e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
440 aa  82  2e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
533 aa  81.3  4e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
532 aa  80.5  7e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 
517 aa  80.1  1e-13  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.11836e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 
262 aa  79  2e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  37.84 
 
 
492 aa  76.6  1e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.02 
 
 
537 aa  76.6  1e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.28 
 
 
530 aa  76.6  1e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  38.3 
 
 
280 aa  75.9  2e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 
430 aa  75.9  2e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
356 aa  75.9  2e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 
493 aa  75.5  3e-12  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 
291 aa  73.6  9e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
359 aa  73.2  1e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  44.44 
 
 
325 aa  73.2  1e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 
513 aa  73.6  1e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 
532 aa  73.2  1e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
292 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
281 aa  72.4  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
292 aa  72.4  2e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  37.23 
 
 
292 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
281 aa  72.4  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
281 aa  72.4  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
292 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  3.16606e-07 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
281 aa  72.8  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
281 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  37.23 
 
 
292 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
309 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
292 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
292 aa  72.8  2e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  37.23 
 
 
281 aa  72.4  2e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  30.11 
 
 
386 aa  71.6  4e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 
546 aa  71.6  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  79.25 
 
 
473 aa  70.9  6e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  37.96 
 
 
241 aa  70.5  7e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
548 aa  70.5  8e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 
350 aa  70.5  8e-11  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.43 
 
 
310 aa  70.1  9e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  41.49 
 
 
314 aa  70.1  1e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5741  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 
295 aa  69.7  1e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188023  normal  0.762448 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
409 aa  69.7  1e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
409 aa  69.7  1e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.43 
 
 
310 aa  70.1  1e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 
515 aa  68.9  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3152  sigma-54 factor, interaction region  33.02 
 
 
440 aa  68.9  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 
288 aa  68.9  2e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
185 aa  68.9  2e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  28.5 
 
 
304 aa  69.3  2e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 
310 aa  69.3  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 
539 aa  68.9  2e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.43 
 
 
305 aa  68.6  3e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11757e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
409 aa  68.6  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
409 aa  68.6  3e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 
265 aa  68.6  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
313 aa  68.6  3e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2180  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
295 aa  68.2  4e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.20744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.43 
 
 
310 aa  67.8  4e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.38 
 
 
304 aa  68.2  4e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.43 
 
 
310 aa  67.8  4e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  37.78 
 
 
284 aa  67.8  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 
414 aa  68.2  4e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40 
 
 
497 aa  68.2  4e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 
411 aa  67.8  5e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40.43 
 
 
310 aa  67.8  5e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
686 aa  67.8  5e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
686 aa  67.8  6e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  40 
 
 
316 aa  67.4  6e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 
409 aa  67.4  6e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  31.07 
 
 
308 aa  67.4  6e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 
409 aa  67.4  6e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 
359 aa  67.4  7e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.07 
 
 
415 aa  67.4  7e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
409 aa  67  7e-10  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
508 aa  67  8e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1970  hypothetical protein  82.98 
 
 
50 aa  67  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 
301 aa  67  8e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 
283 aa  67  9e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>