More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0717 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  83.56 
 
 		 460 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  100 
 
 		 447 aa  885    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  68.31 
 
 		 459 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  99.55 
 
 		 461 aa  880    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  84.91 
 
 		 471 aa  735    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  83.33 
 
 		 460 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  97.09 
 
 		 461 aa  861    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  83.56 
 
 		 460 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  83.56 
 
 		 460 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  100 
 
 		 447 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  98.88 
 
 		 485 aa  876    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  99.55 
 
 		 485 aa  881    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  100 
 
 		 447 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  66.97 
 
 		 464 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  65.77 
 
 		 462 aa  621  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  66.67 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  61.71 
 
 		 463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  61.94 
 
 		 463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  61.49 
 
 		 463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  60.59 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  60.59 
 
 		 463 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  60.59 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  66.67 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  66.9 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  60.81 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  60.59 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  66.67 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  66.67 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  60.81 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  66.9 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  60.59 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  66.9 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  66.67 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  61.04 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  66.07 
 
 		 472 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  66.59 
 
 		 471 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  66.82 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  66.44 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4353  amino acid permease-associated region  66.29 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4561  amino acid permease-associated region  66.22 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  66.44 
 
 		 472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4749  amino acid permease-associated region  62.24 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  57.95 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  53.48 
 
 		 459 aa  501  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  54.34 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  53.91 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3101  putative proline-specific permease  52.26 
 
 		 450 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  52.14 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  52.14 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  52.14 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  52.14 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3272  putative proline-specific permease  51.25 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3132  putative proline-specific permease  51.25 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  52.27 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3282  putative proline-specific permease  51.25 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0197243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1046  putative proline-specific permease  52.04 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3999  putative transport protein YifK  52.58 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  52.25 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2910  putative proline-specific permease  51.58 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2416  amino acid permease-associated region  50.45 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0618668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  52.6 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3992  putative transport protein YifK  52.24 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00908983  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0500  putative proline-specific permease  51.58 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.968025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4021  putative transport protein YifK  50.9 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0268328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0803  amino acid permease-associated region  48.54 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0480085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5276  proline-specific permease proY  49.33 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0524  putative transport protein YifK  50.9 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4834  amino acid permease-associated region  49.55 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.558883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3297  putative proline-specific permease  50.68 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0194  putative transport protein YifK  51.12 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  49.66 
 
 		 452 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0834  amino acid permease-associated region  49.66 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0905  amino acid permease-associated region  49.66 
 
 		 460 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1013  putative proline-specific permease  51.13 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0173  putative transport protein YifK  50.45 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00277796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1788  amino acid permease family protein  51.13 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3168  amino acid permease-associated region  51.13 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.206651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0078  amino acid permease-associated region  48.54 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00350  predicted cryptic proline transporter  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3490  amino acid permease family protein  50.68 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.175253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3207  amino acid permease-associated region  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.168679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0433  putative proline-specific permease  51.58 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00354  hypothetical protein  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0479  putative proline-specific permease  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.339066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0213  putative transport protein YifK  51.24 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3231  putative proline-specific permease  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000934301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0432  putative proline-specific permease  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4084  amino acid permease family protein  48.54 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0472  putative proline-specific permease  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0321  putative proline-specific permease  51.81 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.498957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3459  amino acid permease family protein  50.9 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00571455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4136  amino acid permease family protein  48.54 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.210777  normal  0.0802051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3471  amino acid permease  50.23 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0414864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3262  amino acid permease family protein  50.9 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000532253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3234  amino acid permease  50.45 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  6.42429e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3516  amino acid permease family protein  50.9 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2854  amino acid permease  48.19 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0237037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4125  putative transport protein YifK  51.35 
 
 		 461 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4014  putative transport protein YifK  51.57 
 
 		 461 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.1864e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3477  amino acid permease family protein  50.68 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>