143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0438 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0438  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  288  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  99.29 
 
 
182 aa  287  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  99.29 
 
 
182 aa  287  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  99.29 
 
 
182 aa  287  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  99.29 
 
 
182 aa  287  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  95.77 
 
 
183 aa  275  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  49.57 
 
 
186 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  49.57 
 
 
186 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  49.57 
 
 
186 aa  123  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  47.41 
 
 
182 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  49.18 
 
 
180 aa  120  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  46.1 
 
 
193 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  46.1 
 
 
193 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  49.59 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  49.56 
 
 
178 aa  118  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  48.67 
 
 
179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  46.1 
 
 
1238 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  48.67 
 
 
179 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  48.67 
 
 
179 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  48.67 
 
 
179 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  50.44 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  45.39 
 
 
193 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  44.36 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  45.39 
 
 
193 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  45.39 
 
 
193 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  45.39 
 
 
193 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  49.56 
 
 
172 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  44.53 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  49.56 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  50.44 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  47.86 
 
 
185 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  49.56 
 
 
171 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  42.75 
 
 
180 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  46.83 
 
 
179 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  47.79 
 
 
188 aa  113  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  45.11 
 
 
179 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  46.9 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  41.98 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  41.98 
 
 
180 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  46.9 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.79 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  48.65 
 
 
174 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  41.54 
 
 
168 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  48.65 
 
 
174 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  48.65 
 
 
174 aa  111  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  42.42 
 
 
193 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  40.46 
 
 
168 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  40.74 
 
 
176 aa  105  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  43.36 
 
 
184 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  41.74 
 
 
189 aa  103  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  43.75 
 
 
150 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  43.97 
 
 
178 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  36.03 
 
 
176 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  43.75 
 
 
177 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  40.31 
 
 
167 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  40.18 
 
 
171 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  37.69 
 
 
167 aa  94.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  34.06 
 
 
180 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  40.18 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  39.29 
 
 
179 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  43.22 
 
 
183 aa  92  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  39.29 
 
 
179 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  38.39 
 
 
177 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  39.29 
 
 
191 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  36.07 
 
 
187 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  36.61 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  34.72 
 
 
182 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  38.05 
 
 
176 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  35.97 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468167  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  33.82 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  37.5 
 
 
190 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  33.82 
 
 
181 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024001  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  39.82 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  36.09 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  35.04 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  37.17 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  35.11 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  35.11 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  35.11 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  35.11 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  35.45 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  34.35 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  34.35 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000194603  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  33.58 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  34.31 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  34.31 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  34.31 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  35.29 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  36.11 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  41.3 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  36.5 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2916  hypothetical protein  32.69 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.318874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>