298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0427 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  58.66 
 
 		 688 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  58.87 
 
 		 688 aa  789    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  52.94 
 
 		 669 aa  677    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  85.78 
 
 		 710 aa  1174    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  52.23 
 
 		 676 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  54.29 
 
 		 687 aa  719    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  86.43 
 
 		 713 aa  1177    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 745 aa  1519    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  54.03 
 
 		 684 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  57.65 
 
 		 725 aa  742    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  98.26 
 
 		 749 aa  1474    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  85.78 
 
 		 710 aa  1174    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  98 
 
 		 749 aa  1460    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  58.86 
 
 		 688 aa  798    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  61.48 
 
 		 710 aa  804    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  98.79 
 
 		 745 aa  1498    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  87.16 
 
 		 710 aa  1190    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 745 aa  1519    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  92.43 
 
 		 753 aa  1382    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  54.02 
 
 		 726 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  51.69 
 
 		 681 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  86.54 
 
 		 687 aa  1183    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  51.84 
 
 		 681 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  65.02 
 
 		 724 aa  913    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  57.43 
 
 		 698 aa  742    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  85.78 
 
 		 710 aa  1174    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  52.07 
 
 		 676 aa  665    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  51.84 
 
 		 686 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  100 
 
 		 745 aa  1519    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  58.38 
 
 		 688 aa  788    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  79.19 
 
 		 709 aa  1178    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  61.85 
 
 		 723 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  61.7 
 
 		 719 aa  819    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  45.07 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  45.1 
 
 		 686 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  40.21 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  40.34 
 
 		 667 aa  425  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  39.1 
 
 		 662 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  37.83 
 
 		 668 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 668 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  37.83 
 
 		 668 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  37.88 
 
 		 663 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  37.05 
 
 		 667 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  32.65 
 
 		 695 aa  296  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 672 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.5 
 
 		 665 aa  237  6e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 699 aa  231  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 668 aa  184  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.15 
 
 		 699 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 768 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 681 aa  156  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 702 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 702 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 673 aa  143  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 702 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 760 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 698 aa  112  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 696 aa  107  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 793 aa  101  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 716 aa  98.6  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 775 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 684 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  20.9 
 
 		 780 aa  92  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 721 aa  89.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 685 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 718 aa  88.2  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.32 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 713 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 769 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 751 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 692 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 698 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 725 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 681 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 751 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  29.54 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  23.43 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 698 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  20.93 
 
 		 708 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.59 
 
 		 861 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 724 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 742 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 683 aa  80.5  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 744 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 693 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  37.19 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  20.83 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 741 aa  77.4  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 766 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 706 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 705 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 694 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 713 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  21.32 
 
 		 708 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>