146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0408 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  893    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  95.22 
 
 
492 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  98.46 
 
 
492 aa  725    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  98.46 
 
 
492 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  94.78 
 
 
488 aa  733    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  94.68 
 
 
481 aa  692    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  98.46 
 
 
492 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  76.87 
 
 
427 aa  598  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  67.16 
 
 
367 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  43.64 
 
 
388 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  34 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  34 
 
 
349 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  38.04 
 
 
361 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  38.04 
 
 
361 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  38.04 
 
 
361 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.38 
 
 
346 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  38.04 
 
 
361 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  38.04 
 
 
361 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  38.04 
 
 
361 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  33.43 
 
 
349 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  33.43 
 
 
349 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  33.43 
 
 
349 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  62.84 
 
 
337 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  32.81 
 
 
341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  32.55 
 
 
341 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  32.55 
 
 
341 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  54.19 
 
 
366 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  55.36 
 
 
349 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  55.23 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  61.74 
 
 
388 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  34.52 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  53.38 
 
 
377 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  42.77 
 
 
353 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  42.5 
 
 
353 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  50.33 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  44 
 
 
358 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  39.61 
 
 
348 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  48.98 
 
 
370 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.4 
 
 
385 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  47.95 
 
 
348 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  44.81 
 
 
357 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  42.95 
 
 
358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  43.67 
 
 
359 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  42.95 
 
 
351 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  35.8 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  39.66 
 
 
361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  35.8 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  35.8 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  35.8 
 
 
331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  31.66 
 
 
345 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.81 
 
 
343 aa  89.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  32.24 
 
 
356 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.36 
 
 
349 aa  89  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  33.55 
 
 
356 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  33.55 
 
 
356 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  33.55 
 
 
356 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  33.55 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.46 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  28.27 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.36 
 
 
337 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  27.25 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  27.25 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  27.25 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  26.59 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  25.51 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  28.76 
 
 
338 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  26.3 
 
 
338 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  25.84 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0443  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2079  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  36.64 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0744  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1039  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0794  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.990033  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0705  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2013  hypothetical protein  26.28 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  26.99 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  24.38 
 
 
354 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  31.58 
 
 
321 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  35.43 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  34.65 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  24.52 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  29.58 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  29.58 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  29.58 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  24.74 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.38 
 
 
332 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  30.08 
 
 
361 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.7 
 
 
332 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  32.54 
 
 
374 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  34.88 
 
 
366 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  34.88 
 
 
366 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1896  hypothetical protein  29.58 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  30.82 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  31.14 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  27.01 
 
 
336 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  34.88 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  26.32 
 
 
341 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>