98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMAA0220 on replicon NC_006349
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0965  chemotaxis protein cheW  100 
 
 
201 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0220  chemotaxis protein cheW  100 
 
 
201 aa  384  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.981977  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1598  chemotaxis protein cheW  99.5 
 
 
244 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0257  chemotaxis protein cheW  99.5 
 
 
244 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2539  CheW domain-containing protein  99.5 
 
 
244 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155706  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1401  chemotaxis protein cheW  99.5 
 
 
244 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2684  CheW domain-containing protein  96.06 
 
 
246 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0504  chemotaxis protein cheW  90.05 
 
 
239 aa  310  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3734  CheW protein  58.42 
 
 
233 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576231  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3790  CheW protein  58.42 
 
 
233 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4573  CheW protein  58.42 
 
 
233 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2305  CheW protein  59.9 
 
 
235 aa  221  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4943  CheW protein  57.94 
 
 
247 aa  214  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318865  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5516  CheW protein  56.37 
 
 
240 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334912  normal  0.661174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3682  CheW protein  56.04 
 
 
238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358535  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5392  CheW protein  55.67 
 
 
233 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3976  CheW protein  47.06 
 
 
226 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3650  CheW protein  41.5 
 
 
225 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.107896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3970  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  38.17 
 
 
250 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000212039  hitchhiker  0.0041707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2030  CheW protein  28.92 
 
 
253 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2056  CheW protein  28.92 
 
 
253 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16460  CheW domain-containing protein  39.87 
 
 
229 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1524  CheW protein  31.29 
 
 
246 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4127  CheW protein  41.45 
 
 
221 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0808304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1096  CheW protein  36.97 
 
 
221 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.153582  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4231  putative CheW protein  36.93 
 
 
221 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1491  CheW domain-containing protein  36.93 
 
 
215 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000195231  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1306  CheW-like protein  43.54 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1055  CheW protein  43.54 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1432  hypothetical protein  37.2 
 
 
229 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1496  CheW domain protein  41.5 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0830  CheW-like domain-containing protein  33.52 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  27.45 
 
 
152 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0927  CheW protein  23.57 
 
 
157 aa  55.5  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  27.59 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1348  CheW protein  26.81 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.1 
 
 
189 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  27.27 
 
 
141 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.33 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  25.58 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  28.57 
 
 
162 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  26.49 
 
 
151 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  29.71 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  23.81 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  26.49 
 
 
148 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  26.62 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  28.26 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  26.62 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  27.66 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  26.24 
 
 
167 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.37 
 
 
163 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  24.49 
 
 
156 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  24.49 
 
 
156 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  26.95 
 
 
158 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  29.63 
 
 
139 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  28.93 
 
 
166 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.34 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  29 
 
 
533 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  27.54 
 
 
141 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  26.92 
 
 
159 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  25 
 
 
187 aa  44.7  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  27.36 
 
 
141 aa  44.7  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.61 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.28 
 
 
159 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  27.78 
 
 
262 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  26.24 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  24.46 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  28.36 
 
 
141 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  22.6 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  24.26 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  24.46 
 
 
302 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  23.57 
 
 
154 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  22.98 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.03 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.4 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.03 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  28.17 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  23.74 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  23.74 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  23.74 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.38 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  28.74 
 
 
187 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  22.86 
 
 
154 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  31.29 
 
 
212 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.59 
 
 
165 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  26.9 
 
 
158 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1843  CheW protein  28.78 
 
 
164 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718513  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  26.28 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  26.81 
 
 
155 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.25 
 
 
166 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  26.71 
 
 
140 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  26.62 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.12 
 
 
164 aa  41.2  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25 
 
 
164 aa  41.2  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>