More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3082 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  754  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  100 
 
 
429 aa  754  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  100 
 
 
398 aa  755  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  100 
 
 
398 aa  755  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  99.75 
 
 
398 aa  754  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  100 
 
 
398 aa  755  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  100 
 
 
398 aa  755  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  92.21 
 
 
398 aa  583  1e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  83.5 
 
 
399 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  84.48 
 
 
399 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  84.73 
 
 
399 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  84.73 
 
 
399 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  85.24 
 
 
399 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  85.97 
 
 
399 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  86.22 
 
 
399 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  75.95 
 
 
404 aa  515  1e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  73.15 
 
 
399 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  75.45 
 
 
400 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 
397 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  53.22 
 
 
415 aa  312  8e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  53.24 
 
 
403 aa  308  7e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  53.08 
 
 
394 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 
403 aa  306  4e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  51.55 
 
 
405 aa  302  8e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  52.82 
 
 
394 aa  299  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 
389 aa  300  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  46.09 
 
 
383 aa  299  7e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  47.1 
 
 
395 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  53.08 
 
 
394 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  46.05 
 
 
390 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  44.68 
 
 
403 aa  296  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  2.484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  52.16 
 
 
407 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  49.06 
 
 
391 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  1.66249e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.78 
 
 
394 aa  290  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 
415 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  48.28 
 
 
389 aa  285  1e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  44.41 
 
 
399 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  47.63 
 
 
407 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  51.39 
 
 
402 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  50.83 
 
 
402 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  45.62 
 
 
403 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  44.15 
 
 
399 aa  275  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 
402 aa  275  1e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  45.21 
 
 
399 aa  273  4e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  44.15 
 
 
399 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  45.15 
 
 
385 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 
389 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  51.12 
 
 
408 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 
396 aa  262  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  49.58 
 
 
396 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 
413 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  46.34 
 
 
419 aa  254  2e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  49.16 
 
 
410 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  49.72 
 
 
412 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 
406 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  49.72 
 
 
412 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  49.72 
 
 
412 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 
406 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  42.3 
 
 
394 aa  246  5e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  37.9 
 
 
415 aa  245  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.18 
 
 
394 aa  244  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  46.72 
 
 
403 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  42.04 
 
 
394 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  42.04 
 
 
394 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  44.03 
 
 
400 aa  243  4e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  39.23 
 
 
393 aa  243  4e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  40.05 
 
 
399 aa  242  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  40.05 
 
 
399 aa  242  8e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  40.05 
 
 
399 aa  242  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  46.67 
 
 
399 aa  242  8e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
399 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.73 
 
 
394 aa  240  3e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  40.73 
 
 
394 aa  239  6e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  40.73 
 
 
394 aa  239  6e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  40.73 
 
 
394 aa  239  6e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  40.73 
 
 
394 aa  239  6e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.78 
 
 
394 aa  239  7e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.21 
 
 
394 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
389 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  40.15 
 
 
394 aa  236  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  49.59 
 
 
405 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  46.2 
 
 
399 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  50.58 
 
 
410 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  46.2 
 
 
405 aa  233  4e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  50.58 
 
 
410 aa  233  4e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.78 
 
 
411 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  3.83306e-07 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  46.76 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  46.76 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  46.76 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  46.76 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  46.76 
 
 
399 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 
399 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4753  major facilitator superfamily MFS_1  52.77 
 
 
407 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.84562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 
387 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  42.82 
 
 
398 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1580  major facilitator superfamily MFS_1  51.53 
 
 
425 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.551753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  40.57 
 
 
426 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
410 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
391 aa  226  5e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  39.84 
 
 
389 aa  226  5e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>