More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2562 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  99.74 
 
 		 386 aa  765    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  100 
 
 		 386 aa  768    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  100 
 
 		 436 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  768    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  98.45 
 
 		 436 aa  761    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  100 
 
 		 386 aa  768    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  80.51 
 
 		 389 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  81.14 
 
 		 385 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  81.14 
 
 		 385 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  81.91 
 
 		 383 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  82.17 
 
 		 383 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  82.17 
 
 		 383 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  80.62 
 
 		 383 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  79.23 
 
 		 389 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  77.95 
 
 		 389 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  64.23 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  70.02 
 
 		 402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  62.69 
 
 		 391 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  56.51 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  54.57 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  53.22 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  56.5 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  56.99 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  52.94 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  51.08 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  52.7 
 
 		 400 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  50.75 
 
 		 391 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  47.1 
 
 		 409 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5787  porin  52.86 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  48.24 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  49.37 
 
 		 389 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  48.11 
 
 		 389 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  47.03 
 
 		 383 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  49.13 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48.88 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  47.06 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  45.74 
 
 		 422 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  46.33 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  45.18 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  48.1 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  48.13 
 
 		 381 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  45.65 
 
 		 409 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  45 
 
 		 397 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  45.64 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  48.28 
 
 		 384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.19 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  45.57 
 
 		 421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  45.57 
 
 		 421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  46.43 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  46.62 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0106  OmpC family outer membrane porin  46.81 
 
 		 398 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  45.96 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  47.78 
 
 		 384 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  47.78 
 
 		 384 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  47.37 
 
 		 383 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  47.78 
 
 		 384 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  44.75 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  45.55 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  45.55 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  44.44 
 
 		 397 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  45.55 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.75 
 
 		 381 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  49.12 
 
 		 390 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.35 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.35 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.35 
 
 		 399 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  47.78 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.35 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  45.29 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  45.64 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  49.74 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.25 
 
 		 381 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.35 
 
 		 399 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  45.29 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  47.78 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  49.2 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  48.37 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  44.95 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.36 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  44.91 
 
 		 445 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  47.21 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  47.21 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  47.03 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  46.95 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  46.98 
 
 		 430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  47.21 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  47.21 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  47.21 
 
 		 430 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4950  outer membrane protein, (porin)  44.44 
 
 		 412 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  46.55 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  48.13 
 
 		 390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  48.13 
 
 		 390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>