More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1709 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1709  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1490  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2600  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0660121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2734  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2218  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2656  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3102  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1874  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  98.32 
 
 
179 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2127  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
179 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2164  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
179 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2144  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
179 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.86819 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5433  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
179 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0877391  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1143  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
179 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  0.408262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2037  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  94.41 
 
 
179 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5950  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  93.85 
 
 
179 aa  349  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13672  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1552  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  88.83 
 
 
176 aa  327  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00106628  normal  0.0365649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2580  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  87.71 
 
 
176 aa  324  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157881  hitchhiker  0.000462534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1459  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  87.57 
 
 
174 aa  316  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138815  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0883  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  71.21 
 
 
197 aa  270  8e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.667568  normal  0.213332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0948  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  71.21 
 
 
197 aa  270  8e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.636464  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  75.13 
 
 
184 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591774  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1018  hypothetical protein  73.37 
 
 
193 aa  269  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128019  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1057  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  72.25 
 
 
186 aa  266  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0533537  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4000  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  67.21 
 
 
178 aa  240  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269761  normal  0.0270518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2442  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  67.76 
 
 
178 aa  238  3e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2141  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  67.21 
 
 
178 aa  238  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.426314  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0468  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  65.61 
 
 
189 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.78548e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2145  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  67.76 
 
 
178 aa  237  6e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000992701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1637  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  67.76 
 
 
178 aa  237  6e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1494  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  64.89 
 
 
189 aa  237  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2177  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.57 
 
 
178 aa  234  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00333036  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2291  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.22 
 
 
178 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  4.27362e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2372  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.38 
 
 
179 aa  226  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2263  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.88 
 
 
177 aa  223  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2176  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.2 
 
 
178 aa  218  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  5.32163e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1048  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  60.67 
 
 
177 aa  211  4e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2207  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  68.42 
 
 
160 aa  207  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1948  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  65.41 
 
 
167 aa  198  4e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00171818  normal  0.169559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  62.03 
 
 
153 aa  189  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  4.54822e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.69 
 
 
156 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.46494e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0674  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  62.91 
 
 
157 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.50812e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0694  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  62.22 
 
 
172 aa  172  2e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  9.40296e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2883  Rrf2 family protein  57.45 
 
 
162 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0829  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.14 
 
 
164 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1412  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.09 
 
 
164 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.612266  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1121  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.03 
 
 
165 aa  164  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14710  putative Rrf2 family protein  55.26 
 
 
163 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259526  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1298  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  55.26 
 
 
163 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3512  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.61 
 
 
165 aa  163  1e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112818  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1648  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  57.46 
 
 
166 aa  162  2e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.223295  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4613  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  50.91 
 
 
163 aa  162  2e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0841  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.74 
 
 
163 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0871  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.74 
 
 
182 aa  161  4e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0884  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  56.74 
 
 
182 aa  161  4e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360129  hitchhiker  0.00284827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2060  iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  52.74 
 
 
162 aa  161  5e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0325541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1422  rrf2 family protein  56.03 
 
 
163 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1236  transcription factor IscR  56.03 
 
 
163 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507944  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1887  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.38 
 
 
158 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.342013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2752  DNA-binding transcriptional regulator IscR  54.01 
 
 
164 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0761985  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2847  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.54 
 
 
178 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1326  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  56.92 
 
 
159 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0470001  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1237  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.55 
 
 
161 aa  158  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00337607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3064  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  61.19 
 
 
157 aa  158  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  5.52074e-05  unclonable  6.47935e-07 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1131  Rrf2 family protein  52.48 
 
 
168 aa  158  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1323  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  54.81 
 
 
158 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  9.41019e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40410  Iron-sulphur cluster assembly transcription factor IscR  50.3 
 
 
164 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2425  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  53.57 
 
 
153 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3628  DNA-binding transcriptional regulator IscR  53.28 
 
 
164 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000895499  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1167  DNA-binding transcriptional regulator IscR  53.28 
 
 
164 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000157606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0436  DNA-binding transcriptional regulator IscR  53.28 
 
 
164 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.233934  hitchhiker  0.000107797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1343  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.9 
 
 
162 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.34779e-07 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1486  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  56.62 
 
 
158 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000176425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1275  DNA-binding transcriptional regulator IscR  53.28 
 
 
185 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.4653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01355  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.35 
 
 
161 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0210581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1103  DNA-binding transcriptional regulator IscR  52.55 
 
 
164 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00126529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1292  Rrf2 family protein  53.28 
 
 
153 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418655  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1243  DNA-binding transcriptional regulator IscR  51.82 
 
 
164 aa  155  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.510917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3032  DNA-binding transcriptional regulator IscR  51.82 
 
 
164 aa  154  5e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.178839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0617  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.08 
 
 
142 aa  154  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.51443e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2398  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00199156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2387  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.99976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1818  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1738  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.71223e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2503  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000333652  normal  0.0233016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2281  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00598103  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1960  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  53.28 
 
 
153 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00367756  hitchhiker  0.00162465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2263  Rrf2 family protein  53.28 
 
 
153 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2150  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 
153 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00595476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1457  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  51.82 
 
 
153 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0691454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0276  hypothetical protein  52.99 
 
 
188 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00556967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01054  hypothetical protein  51.06 
 
 
168 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2318  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.55 
 
 
153 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0363364  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0716  HTH-type transcriptional regulator  50 
 
 
168 aa  151  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  51.82 
 
 
153 aa  151  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.675644  hitchhiker  1.82952e-08 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2028  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.69 
 
 
154 aa  151  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0111127  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0672  iron-sulfur cluster assembly transcription factor IscR  50.97 
 
 
162 aa  151  6e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.468922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0821  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  50.97 
 
 
162 aa  151  6e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000871851  normal  0.998171 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2189  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  52.55 
 
 
167 aa  150  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3264  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  54.81 
 
 
164 aa  150  9e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3459  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.63 
 
 
182 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>