More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1400 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  83.88 
 
 
473 aa  781    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  96.96 
 
 
462 aa  895    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  80.61 
 
 
463 aa  757    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  97.17 
 
 
460 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  72.12 
 
 
463 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  66.67 
 
 
470 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  97.61 
 
 
460 aa  902    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  68.13 
 
 
470 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  99.78 
 
 
460 aa  940    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  70.43 
 
 
462 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  95.44 
 
 
461 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  81.26 
 
 
463 aa  762    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  95.66 
 
 
461 aa  887    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  97.39 
 
 
460 aa  901    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  96.96 
 
 
460 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  97.39 
 
 
460 aa  901    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  83.19 
 
 
462 aa  784    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  97.61 
 
 
460 aa  904    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  83.41 
 
 
462 aa  785    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  100 
 
 
460 aa  940    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  67.42 
 
 
465 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  63.33 
 
 
468 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  67.26 
 
 
469 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  61.73 
 
 
473 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  61.2 
 
 
472 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  63.27 
 
 
461 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  63.94 
 
 
471 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  63.96 
 
 
472 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  63 
 
 
461 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  60.22 
 
 
477 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  61.33 
 
 
469 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  63.25 
 
 
473 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  61.4 
 
 
472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  61.4 
 
 
472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  60.36 
 
 
469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  64.59 
 
 
479 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  60 
 
 
465 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  59.47 
 
 
465 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  59.25 
 
 
465 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  59.47 
 
 
465 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  61.12 
 
 
460 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  61.35 
 
 
460 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  58.23 
 
 
464 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  58.66 
 
 
465 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  59.82 
 
 
462 aa  548  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  58.01 
 
 
464 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  58.52 
 
 
464 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  58.59 
 
 
468 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  58.59 
 
 
468 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  58.59 
 
 
468 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  58.52 
 
 
464 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  58.55 
 
 
468 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  59.65 
 
 
472 aa  543  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  58.37 
 
 
468 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  58.37 
 
 
468 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
468 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  58.15 
 
 
468 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  58.15 
 
 
468 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  58.15 
 
 
468 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  57.71 
 
 
468 aa  535  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  58.15 
 
 
468 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  57.93 
 
 
468 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  57.52 
 
 
466 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  57.49 
 
 
468 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  57.49 
 
 
463 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  57.24 
 
 
468 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  57.64 
 
 
464 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  57.78 
 
 
468 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  57.21 
 
 
472 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  56.61 
 
 
465 aa  525  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  58.06 
 
 
468 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  56.8 
 
 
468 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  56.73 
 
 
467 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  56.8 
 
 
468 aa  520  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  55.8 
 
 
468 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  55.8 
 
 
468 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  56.17 
 
 
474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  56.29 
 
 
468 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  56.47 
 
 
458 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  56.51 
 
 
471 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  56.51 
 
 
471 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  56.51 
 
 
471 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  56.73 
 
 
471 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  56.51 
 
 
471 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  57.3 
 
 
466 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  56.51 
 
 
471 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  56.51 
 
 
471 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  56.51 
 
 
471 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  56.73 
 
 
471 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  56.73 
 
 
471 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  56.73 
 
 
471 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  56.73 
 
 
471 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  56.29 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  56.29 
 
 
471 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>