More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1360 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  97.22 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  210  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  210  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  95.37 
 
 
108 aa  209  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  94.44 
 
 
108 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  90.74 
 
 
108 aa  200  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  90.74 
 
 
108 aa  200  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  78.7 
 
 
108 aa  180  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  80 
 
 
115 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  80 
 
 
115 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  76.85 
 
 
108 aa  176  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  79.13 
 
 
115 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  76.85 
 
 
108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  73.15 
 
 
108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  74.07 
 
 
108 aa  170  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  76.64 
 
 
110 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  76.64 
 
 
110 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  75.93 
 
 
107 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  75.93 
 
 
107 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1508  hypothetical protein  75.7 
 
 
110 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2349  hypothetical protein  75.7 
 
 
110 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0510  hypothetical protein  73.83 
 
 
110 aa  160  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1458  hypothetical protein  74.77 
 
 
110 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.542371  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2269  hypothetical protein  72.9 
 
 
110 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710501  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  158  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  72.9 
 
 
110 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  69.44 
 
 
108 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  70.37 
 
 
108 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  70.37 
 
 
111 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  69.37 
 
 
111 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  66.36 
 
 
109 aa  151  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  67.59 
 
 
108 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1671  hypothetical protein  69.16 
 
 
110 aa  149  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  66.36 
 
 
107 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  149  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  63.89 
 
 
108 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  67.92 
 
 
109 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3645  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1826  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0162529  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  65.09 
 
 
109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  64.15 
 
 
109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  65.09 
 
 
109 aa  144  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  64.15 
 
 
120 aa  142  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  63.21 
 
 
109 aa  141  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  65.05 
 
 
106 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  66.67 
 
 
99 aa  140  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  63.21 
 
 
109 aa  140  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  61.68 
 
 
111 aa  140  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  67.68 
 
 
110 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  59.26 
 
 
108 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  57.94 
 
 
107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  62.96 
 
 
107 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  62.96 
 
 
107 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  61.32 
 
 
109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  63.21 
 
 
109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  60.19 
 
 
108 aa  134  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  61.32 
 
 
109 aa  134  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  61.32 
 
 
109 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0645  hypothetical protein  59.26 
 
 
107 aa  134  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  61.68 
 
 
106 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  61.32 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  61.32 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  64.95 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  61.32 
 
 
109 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  59.43 
 
 
110 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0701  hypothetical protein  58.33 
 
 
107 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  59.22 
 
 
109 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  60.38 
 
 
109 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  60.38 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  60.38 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  60.38 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>