133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1044 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1136    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  99.82 
 
 
559 aa  1134    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  74.69 
 
 
561 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  96.78 
 
 
597 aa  1074    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  70.04 
 
 
569 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  75.31 
 
 
561 aa  852    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  75.22 
 
 
561 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  75.31 
 
 
561 aa  852    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1114    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1114    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  99.46 
 
 
551 aa  1110    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  99.82 
 
 
551 aa  1113    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1114    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  69.35 
 
 
569 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  75.22 
 
 
561 aa  851    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  77.05 
 
 
561 aa  871    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  75.4 
 
 
561 aa  860    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  44.75 
 
 
557 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.2 
 
 
581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  44.2 
 
 
581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  44.88 
 
 
555 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  41.9 
 
 
558 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  37.43 
 
 
565 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  35.08 
 
 
558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.37 
 
 
552 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.97 
 
 
554 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.06 
 
 
554 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  27.86 
 
 
574 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  27.32 
 
 
588 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.16 
 
 
559 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.9 
 
 
572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.3 
 
 
568 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.09 
 
 
568 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.24 
 
 
553 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  25.45 
 
 
624 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  23.9 
 
 
553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.7 
 
 
592 aa  115  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.25 
 
 
560 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.84 
 
 
583 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.9 
 
 
607 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.89 
 
 
589 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  23.85 
 
 
599 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
747 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.89 
 
 
607 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25.2 
 
 
587 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.98 
 
 
548 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.96 
 
 
572 aa  97.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.21 
 
 
587 aa  97.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  23.7 
 
 
550 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  22.89 
 
 
548 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.71 
 
 
576 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.58 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.43 
 
 
692 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.32 
 
 
567 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  22.99 
 
 
545 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.72 
 
 
585 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.71 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.98 
 
 
578 aa  77.4  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.49 
 
 
556 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.79 
 
 
584 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.85 
 
 
592 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.22 
 
 
590 aa  70.9  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.77 
 
 
567 aa  70.5  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.04 
 
 
1349 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  23.13 
 
 
567 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  23.13 
 
 
567 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.84 
 
 
1391 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  25.75 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  23.15 
 
 
575 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.93 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.75 
 
 
550 aa  67  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.28 
 
 
571 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.1 
 
 
1570 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.43 
 
 
592 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  23.61 
 
 
562 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  23.61 
 
 
562 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.73 
 
 
567 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  26.81 
 
 
595 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  28.99 
 
 
575 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.72 
 
 
562 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  21.55 
 
 
442 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  22.51 
 
 
565 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  24.57 
 
 
590 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.18 
 
 
541 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.41 
 
 
538 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.13 
 
 
585 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.35 
 
 
547 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.44 
 
 
595 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.36 
 
 
561 aa  58.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  30.28 
 
 
585 aa  57.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.78 
 
 
554 aa  57  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  31.15 
 
 
692 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.5 
 
 
579 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.93 
 
 
584 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  23.56 
 
 
558 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.93 
 
 
639 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.32 
 
 
546 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35 
 
 
543 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  31.34 
 
 
608 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  29.27 
 
 
531 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>