More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2222 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2222  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1943  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366238  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.127148  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1660  hypothetical protein  97.13 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0293  outer membrane porin OpcP  97.13 
 
 		 209 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  83.17 
 
 		 382 aa  344  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  63.85 
 
 		 386 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  52.17 
 
 		 391 aa  210  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  49.05 
 
 		 384 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0203  porin domain-containing protein  96.84 
 
 		 95 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  47.12 
 
 		 389 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  47.12 
 
 		 389 aa  187  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  46.63 
 
 		 389 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  49.52 
 
 		 382 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  49.52 
 
 		 382 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41.06 
 
 		 383 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  45.19 
 
 		 381 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  43.27 
 
 		 380 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  40.1 
 
 		 383 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  38.78 
 
 		 383 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  36.99 
 
 		 396 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  37.44 
 
 		 394 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  39.32 
 
 		 381 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  38.16 
 
 		 384 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  36.06 
 
 		 384 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  36.89 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  36.89 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  36.89 
 
 		 384 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  36.06 
 
 		 414 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  36.41 
 
 		 384 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  36.99 
 
 		 394 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  36.89 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  35.92 
 
 		 384 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  38.16 
 
 		 382 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  34.3 
 
 		 383 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6021  porin  37.86 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  36.54 
 
 		 386 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  34.63 
 
 		 385 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  36.23 
 
 		 386 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  38.29 
 
 		 383 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  37.14 
 
 		 383 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  38.46 
 
 		 375 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  35.71 
 
 		 375 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  35.12 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  35.68 
 
 		 376 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  36.36 
 
 		 379 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  34.76 
 
 		 375 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  34.76 
 
 		 375 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.07 
 
 		 384 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  37.14 
 
 		 383 aa  104  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  36.87 
 
 		 403 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  35 
 
 		 391 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  34.55 
 
 		 409 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  34.55 
 
 		 409 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  33.02 
 
 		 383 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  33.02 
 
 		 374 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  33.02 
 
 		 383 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  33.64 
 
 		 379 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  33.01 
 
 		 379 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  35.94 
 
 		 418 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  33.01 
 
 		 379 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  33.01 
 
 		 379 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  33.01 
 
 		 379 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  33.01 
 
 		 379 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  36.53 
 
 		 375 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.79 
 
 		 384 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  35.48 
 
 		 418 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  35.85 
 
 		 471 aa  98.2  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  34.56 
 
 		 403 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  34.56 
 
 		 398 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  34.56 
 
 		 403 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.04 
 
 		 381 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  36.41 
 
 		 381 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  31.58 
 
 		 379 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.19 
 
 		 387 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  28.91 
 
 		 385 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  30.88 
 
 		 386 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  31.28 
 
 		 381 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  32.71 
 
 		 380 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 386 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  35.39 
 
 		 384 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  31.67 
 
 		 380 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  32.58 
 
 		 386 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.29 
 
 		 380 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  36.79 
 
 		 419 aa  89  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  35.39 
 
 		 384 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  31.31 
 
 		 381 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  34.68 
 
 		 379 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1124  OmpC family outer membrane porin  33.49 
 
 		 395 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  34.83 
 
 		 384 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>