288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2051 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0785  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1078  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0381421  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1941  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2014  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0295784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2051  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0533  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0631  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.985518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03460  tRNA-Ser  97.8 
 
 
91 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0034  tRNA-Ser  97.8 
 
 
91 bp  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0024  tRNA-Ser  97.8 
 
 
91 bp  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0029  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.467256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0033  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0062  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0088  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0062  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0062  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0060  tRNA-Ser  96.7 
 
 
91 bp  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0070  tRNA-Ser  96.59 
 
 
88 bp  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.399314  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0036  tRNA-Ser  95.6 
 
 
91 bp  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688413  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0059  tRNA-Ser  94.51 
 
 
91 bp  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000963378  hitchhiker  0.00000000000285313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0030  tRNA-Ser  94.51 
 
 
91 bp  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00350968  decreased coverage  0.0000118989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0016  tRNA-Ser  93.41 
 
 
91 bp  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0030  tRNA-Ser  89.01 
 
 
91 bp  93.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.596087  normal  0.116932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  89.74 
 
 
90 bp  91.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0047  tRNA-Ser  87.91 
 
 
91 bp  85.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0212707  normal  0.0426305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0044  tRNA-Ser  86.67 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0213479 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0057  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.0269773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  88.46 
 
 
92 bp  83.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  88.46 
 
 
90 bp  83.8  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  88.61 
 
 
91 bp  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.179799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0052  tRNA-Ser  97.67 
 
 
91 bp  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258568  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0041  tRNA-Ser  86.81 
 
 
91 bp  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142753  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  87.18 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0048  tRNA-Ser  85.56 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0101109  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0062  tRNA-Ser  87.18 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.633699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0049  tRNA-Ser  85.56 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0064  tRNA-Ser  87.18 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  87.18 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  87.18 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0042  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  75.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.399999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0035  tRNA-Ser  85.56 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.802654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  87.18 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0047  tRNA-Ser  85.56 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.327618  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0024  tRNA-Ser  85.56 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0041  tRNA-Ser  85.56 
 
 
90 bp  75.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.589584  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0001  tRNA-Ser  95.56 
 
 
90 bp  73.8  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0040  tRNA-Ser  90.77 
 
 
91 bp  73.8  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0019  tRNA-Ser  88.73 
 
 
91 bp  69.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.698383 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0035  tRNA-Ser  88.73 
 
 
91 bp  69.9  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0004  tRNA-Ser  85.9 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.888303  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0051    84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0008  tRNA-Ser  86.49 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA6  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0015  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0069  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.234081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0023  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928958  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0059  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00925485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  84.44 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0029  tRNA-Ser  97.37 
 
 
91 bp  67.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tSer01  tRNA-Ser  85.9 
 
 
93 bp  67.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0568907  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4596  tRNA-Ser  85.9 
 
 
90 bp  67.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA5  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0419374  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0008    93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0798492  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0003  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0003  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0021  tRNA-Ser  97.3 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0003  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0016  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 
90 bp  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.4364  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0051  tRNA-Ser  87.5 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00319398  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0044  tRNA-Ser  87.5 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0055  tRNA-Ser  87.5 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0040  tRNA-Ser  87.5 
 
 
90 bp  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0006  tRNA-Ser  86.08 
 
 
91 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0006  tRNA-Ser  86.08 
 
 
91 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.22052e-25 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  86.08 
 
 
91 bp  61.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  84.62 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna37  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  60  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  60  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.355586  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  60  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  84.62 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0006  tRNA-Ser  92.86 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0906398  normal  0.0288361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  84.62 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  84.62 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0052  tRNA-Ser  92.86 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  60  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0004  tRNA-Ser  92.86 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0004  tRNA-Ser  92.86 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  84.62 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2302  tRNA-Ser  84.62 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0005  tRNA-Ser  97.06 
 
 
95 bp  60  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0056  tRNA-Ser  87.69 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0030  tRNA-Ser  94.59 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191497  normal  0.473607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0002  tRNA-Ser  87.69 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00130042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>