More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1541 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  99.52 
 
 
209 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  99.52 
 
 
209 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  99.52 
 
 
209 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  100 
 
 
209 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  99.04 
 
 
209 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  48.17 
 
 
193 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  48.17 
 
 
193 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  48.17 
 
 
193 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  41.18 
 
 
203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  42.11 
 
 
194 aa  148  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  39.29 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  43.98 
 
 
193 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.23 
 
 
204 aa  138  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.2 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  35.63 
 
 
174 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  36.46 
 
 
201 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  36.21 
 
 
196 aa  108  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  37.14 
 
 
198 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.33 
 
 
197 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  35 
 
 
192 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.12 
 
 
205 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  33.87 
 
 
226 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  31.12 
 
 
212 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 
202 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  33.15 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  31.87 
 
 
206 aa  99  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  33.51 
 
 
190 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  27.84 
 
 
198 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  27.84 
 
 
198 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  27.84 
 
 
198 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  30.22 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  34.76 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  31.8 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  34.24 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  35.45 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  32.26 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  30.88 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  31.72 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  33.91 
 
 
175 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  31.35 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  31.02 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  28.23 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.28 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  28.23 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  31.18 
 
 
211 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  28.08 
 
 
235 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  34.69 
 
 
819 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  34.48 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  28.73 
 
 
199 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.68 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  34.17 
 
 
825 aa  84.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0196  ubiquinol oxidase, subunit III  31.67 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  30.98 
 
 
209 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  32.61 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.71 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  29.71 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5826  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.61 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.550286  normal  0.42058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.71 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  28.02 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.14 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  26.5 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0227  ubiquinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2570  ubiquinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1371  ubiquinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.819538  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  33.89 
 
 
827 aa  81.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  36.88 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0368  cytochrome c oxidase, subunit III  29.67 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  25.55 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  27.68 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  33.15 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0481  cytochrome c oxidase subunit III  30.56 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  32.78 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30.85 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.71 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0991  ubiquinol oxidase, subunit III  31.11 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.532758  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  26.85 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1568  ubiquinol oxidase, subunit III  30.56 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  28.11 
 
 
234 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  30.86 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  28.49 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  29.78 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  28 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  29.48 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  31.79 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  33.54 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  28.98 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  28.32 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  33.79 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  31.61 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  28.7 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>