More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0854 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  97.9 
 
 		 425 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  39.01 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  33.62 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  32.11 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  36.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  34.8 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 234 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.36 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  36.65 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  34.57 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  34.57 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  37.5 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.7 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  35.22 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 239 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  34.39 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  35.71 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  33.97 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.97 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.97 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1442  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.600459  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4435  LuxR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.07 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0282  transcriptional regulator, LuxR family  31.9 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0127  transcriptional regulator, LuxR family  30.14 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.56 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  32.89 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4396  LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  32.89 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6408  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6378  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  32.43 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  32.43 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  32.43 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.43 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  32.06 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9665  two-component transcriptional regulator LuxR family  29.69 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4509  autoinducer-binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2015  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.63 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000284169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0127  transcriptional regulator, LuxR family  33.51 
 
 		 206 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1723  DNA-binding transcriptional activator SdiA  30.63 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00781439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0791  LuxR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0904596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>