More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0811 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  61.48 
 
 		 506 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  99.47 
 
 		 564 aa  1105    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 506 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 564 aa  1110    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 506 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 546 aa  966    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 509 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  99.47 
 
 		 564 aa  1105    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  82.63 
 
 		 503 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  83.11 
 
 		 502 aa  858    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 506 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  79.85 
 
 		 520 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  93.7 
 
 		 562 aa  914    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 564 aa  1110    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  80.31 
 
 		 501 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  79.34 
 
 		 501 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 513 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 502 aa  859    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  72.41 
 
 		 523 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  83.3 
 
 		 502 aa  858    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  100 
 
 		 561 aa  966    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  82.8 
 
 		 502 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.73 
 
 		 515 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  84.67 
 
 		 503 aa  865    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  82.8 
 
 		 502 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  61.28 
 
 		 506 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  61.28 
 
 		 506 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  60.87 
 
 		 521 aa  633  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  60.42 
 
 		 511 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 507 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  60.81 
 
 		 507 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 507 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  59.46 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 569 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  57.31 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  54.32 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.89 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.59 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.48 
 
 		 501 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  47.9 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.19 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  46.61 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  47.1 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  49.12 
 
 		 502 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.9 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  43.35 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.64 
 
 		 494 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 495 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  42.36 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 492 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.2 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 511 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  44.4 
 
 		 502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 498 aa  342  9e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 502 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 502 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 502 aa  342  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 490 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.16 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  43.6 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  40.36 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 488 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 488 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 492 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.58 
 
 		 494 aa  319  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  42.46 
 
 		 506 aa  316  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 502 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 492 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.03 
 
 		 489 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.45 
 
 		 523 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  40.56 
 
 		 488 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  37 
 
 		 478 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 487 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.5 
 
 		 485 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  40.04 
 
 		 481 aa  295  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 487 aa  293  4e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.85 
 
 		 472 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.43 
 
 		 514 aa  293  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.47 
 
 		 471 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.57 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  38.09 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>