106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0700 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1577  N-acyl homoserine lactone synthase  100 
 
 
202 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0618  N-acylhomoserine lactone synthase  99.5 
 
 
289 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0541466  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2022  autoinducer synthetase  100 
 
 
202 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2216  autoinducer synthetase BpmI  99.5 
 
 
275 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0690156  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2129  autoinducer synthetase BpmI  99.5 
 
 
202 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.466862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0700  autoinducer synthetase BpmI  100 
 
 
202 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0804  N-acyl homoserine lactone synthase  91.58 
 
 
268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.648666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0126  autoinducer synthesis protein  53.51 
 
 
237 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0415  putative autoinducer synthesis protein  49.25 
 
 
249 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4280  autoinducer synthesis protein  46.07 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0241247  normal  0.0105559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3641  autoinducer synthesis protein  43.72 
 
 
202 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000011065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4726  autoinducer synthesis protein  43.72 
 
 
202 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455128  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3969  autoinducer synthesis protein  43.3 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163172  normal  0.0220737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4583  autoinducer synthesis protein  43.72 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141788  hitchhiker  0.0000655879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1050  autoinducer synthesis protein  43.72 
 
 
202 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000000830053  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4118  autoinducer synthesis protein  43.17 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000553872  hitchhiker  0.00840845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5574  autoinducer synthesis protein  43.72 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000539644  hitchhiker  0.00691296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1512  N-acyl homoserine lactone synthase  45.09 
 
 
203 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0575581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1650  autoinducer synthesis protein RhlI  41.67 
 
 
202 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1347  autoinducer synthetase family protein  45.09 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0331  autoinducer synthase BpsI  45.09 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0609  autoinducer synthase BpsI  45.09 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0960  autoinducer synthase BpsI  45.09 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2483  N-acylhomoserine lactone synthase  45.09 
 
 
203 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1293  autoinducer synthase BpsI  45.09 
 
 
203 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1221  autoinducer synthase BpsI  45.09 
 
 
203 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.653596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19130  autoinducer synthesis protein RhlI  41.67 
 
 
201 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347386  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0965  Acyl-homoserine-lactone synthase  43.65 
 
 
188 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.397594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3286  autoinducer synthesis protein SOLI  43.01 
 
 
204 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498186  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5808  Acyl-homoserine-lactone synthase  37.84 
 
 
220 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.167675  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6053  autoinducer synthesis protein  32.34 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5823  autoinducer synthesis protein  32.18 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960322  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1666  autoinducer synthesis protein  38.25 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.852162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1999  autoinducer synthesis protein  38.25 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.556283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1227  N-acyl homoserine lactone synthase  35.79 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0957  autoinducer synthesis protein LuxI  33.15 
 
 
193 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0145  N-acylhomoserine lactone synthase  34.9 
 
 
206 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0460086  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1658  autoinducer synthetase  34.9 
 
 
206 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0115176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1577  autoinducer synthetase  34.9 
 
 
206 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24654  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01928  autoinducer synthase  37.63 
 
 
182 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.697337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2390  autoinducer synthesis protein  34.81 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0361  autoinducer synthesis protein  33.53 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3498  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.95 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.364609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1760  autoinducer synthesis protein  34.87 
 
 
210 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0123  autoinducer synthesis protein  34.67 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4437  autoinducer synthesis protein  35.19 
 
 
195 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1710  autoinducer synthesis protein  31.41 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0765757  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0608  putative autoinducer synthesis protein  35.93 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4275  autoinducer synthesis protein  35.93 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.722573  normal  0.550742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0701  autoinducer synthesis protein  38.95 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6377  putative autoinducer synthesis protein  33.62 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6407  putative autoinducer synthesis protein  33.62 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1765  autoinducer synthesis protein  35.25 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0941  autoinducer synthesis protein  33.11 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0259  autoinducer synthesis protein TraI (conjugation factor synthetase)  33.1 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1889  autoinducer synthesis protein  30.98 
 
 
214 aa  71.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3811  autoinducer synthesis protein  38.64 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5461  autoinducer synthesis protein  33.88 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3897  autoinducer synthesis protein LasI  33.93 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5028  autoinducer synthesis protein  34.65 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.548856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45940  autoinducer synthesis protein LasI  35.85 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5481  putative autoinducer synthesis protein  32.19 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8335  putative autoinducer synthesis protein  28.4 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.613519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4513  autoinducer synthesis protein  33.86 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4976  autoinducer synthesis protein  33.86 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1560  autoinducer synthesis protein  28.26 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.766209  normal  0.485309 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4570  putative autoinducer synthesis protein  31.25 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0626  autoinducer synthesis protein  27.78 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196351  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9270  putative autoinducer synthesis protein  28.83 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5375  putative autoinducer synthesis protein  30.06 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0563585  normal  0.248437 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4466  autoinducer synthase  35.66 
 
 
207 aa  61.6  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5763  autoinducer synthesis protein  36.96 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124199  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0959  autoinducer synthesis protein  29.08 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2526  autoinducer synthesis protein  42.05 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2312  autoinducer synthesis protein  29.37 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.362295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4020  autoinducer synthesis protein  35.48 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.111702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3320  autoinducer synthesis protein  29.69 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2175  autoinducer synthesis protein  29.37 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.533935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2331  autoinducer synthesis protein  29.37 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.933975  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9666  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  27.33 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2929  autoinducer synthesis protein  28.86 
 
 
221 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71548  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2668  autoinducer synthesis protein  29.61 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637117  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0919  autoinducer synthesis protein  25.57 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1621  autoinducer synthesis protein  27.71 
 
 
226 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.672835  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6489  autoinducer synthesis protein  34.48 
 
 
119 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191421  normal  0.837558 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2851  autoinducer synthetase  29.82 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3396  autoinducer synthesis protein  25.79 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2589  autoinducer synthesis protein  28.66 
 
 
208 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0417  autoinducer synthesis protein  34.07 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5196  autoinducer synthesis protein  25.5 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.282022  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0283  autoinducer synthesis protein  34.65 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567704  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0312  N-acyl-L-homoserine lactone synthetase-like protein  29.14 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.434992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0098  autoinducer synthesis protein  23.33 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0719  N-acylhomoserine lactone synthase YtbI  23.08 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0792  autoinducer synthesis protein  23.08 
 
 
216 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7113  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  26.05 
 
 
227 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3864  autoinducer synthesis protein PsyI  28.05 
 
 
244 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0322  putative autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  32.26 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2029  autoinducer synthesis protein  27.82 
 
 
216 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0403  autoinducer (acylhomoserine lactone) synthase  29.67 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>