More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0554 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  99.74 
 
 
430 aa  768  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  100 
 
 
384 aa  770  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  99.74 
 
 
430 aa  768  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  99.74 
 
 
384 aa  767  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  100 
 
 
384 aa  770  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  100 
 
 
411 aa  770  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  100 
 
 
384 aa  770  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  82.51 
 
 
523 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  81.35 
 
 
385 aa  576  1e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  79.22 
 
 
386 aa  570  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  77.47 
 
 
385 aa  563  1e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  78.5 
 
 
385 aa  561  1e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  74.94 
 
 
394 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  76.1 
 
 
385 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  76.1 
 
 
385 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  75.82 
 
 
385 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  66.15 
 
 
386 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  66.15 
 
 
386 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  66.15 
 
 
386 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  65.38 
 
 
387 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  67.96 
 
 
386 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  66.15 
 
 
386 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  66.15 
 
 
386 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  66.15 
 
 
386 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  67.86 
 
 
388 aa  491  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  66.16 
 
 
393 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  61.54 
 
 
390 aa  469  1e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  65.65 
 
 
393 aa  466  1e-130  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  63.37 
 
 
404 aa  460  1e-128  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  60.63 
 
 
386 aa  459  1e-128  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  61.71 
 
 
386 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  60.05 
 
 
386 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  59.79 
 
 
386 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  58.76 
 
 
390 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  60.77 
 
 
386 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  60.77 
 
 
386 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  58.86 
 
 
390 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  57.29 
 
 
390 aa  416  1e-115  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  58.31 
 
 
390 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  58.31 
 
 
390 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  56.78 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  57.07 
 
 
430 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  58.04 
 
 
390 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  57.33 
 
 
430 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  56.81 
 
 
390 aa  406  1e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  57.07 
 
 
430 aa  408  1e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  56.81 
 
 
430 aa  406  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  56.81 
 
 
430 aa  406  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  56.81 
 
 
430 aa  406  1e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  55.06 
 
 
376 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  51.43 
 
 
376 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  51.43 
 
 
376 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  51.17 
 
 
376 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  50 
 
 
389 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  46.29 
 
 
397 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  46.27 
 
 
421 aa  312  7e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  46.27 
 
 
421 aa  312  7e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.09 
 
 
385 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.84 
 
 
385 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  46.52 
 
 
397 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  48.76 
 
 
391 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.12 
 
 
389 aa  309  6e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  46.02 
 
 
397 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  46.02 
 
 
397 aa  308  1e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  46.97 
 
 
445 aa  303  5e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.84 
 
 
383 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  44.8 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  44.8 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  44.8 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  44.8 
 
 
399 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.55 
 
 
436 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  44.8 
 
 
399 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  45.79 
 
 
397 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  47.33 
 
 
383 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  46.04 
 
 
436 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  46.04 
 
 
386 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.07 
 
 
383 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  46.04 
 
 
386 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  46.04 
 
 
386 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  46.04 
 
 
386 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  46.04 
 
 
386 aa  293  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.07 
 
 
383 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  45.19 
 
 
391 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.78 
 
 
386 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.15 
 
 
389 aa  283  4e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.09 
 
 
389 aa  282  6e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.95 
 
 
380 aa  275  1e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  45.3 
 
 
395 aa  272  8e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  45.62 
 
 
384 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.7 
 
 
383 aa  268  9e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  45.18 
 
 
402 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.7 
 
 
380 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  45.01 
 
 
394 aa  267  3e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  45.01 
 
 
395 aa  267  3e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>